Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTCH1Q13635 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PTCH1Q13635 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PTCH1Q13635 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PTCH1Q13635 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PTCH1Q13635 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PTCH1Q13635 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTCH1Q13635 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTCH1Q13635 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTCH1Q13635 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTCH1Q13635 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
PTCH1Q13635 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTCH1Q13635 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTCH1Q13635 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTCH1Q13635 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
PTCH1Q13635 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
PTCH1Q13635 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
PTCH1Q13635 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PTCH1Q13635 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PTCH1Q13635 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PTCH1Q13635 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PTCH1Q13635 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PTCH1Q13635 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PTCH1Q13635 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PTCH1Q13635 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PTCH1Q13635 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PTCH1Q13635 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PTCH1Q13635 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PTCH1Q13635 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTCH1Q13635 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTCH1Q13635 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTCH1Q13635 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
PTCH1Q13635 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTCH1Q13635 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTCH1Q13635 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTCH1Q13635 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTCH1Q13635 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTCH1Q13635 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTCH1Q13635 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTCH1Q13635 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTCH1Q13635 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTCH1Q13635 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTCH1Q13635 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTCH1Q13635 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
PTCH1Q13635 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTCH1Q13635 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PTCH1Q13635 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PTCH1Q13635 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PTCH1Q13635 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PTCH1Q13635 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
PTCH1Q13635 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PTCH1Q13635 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
PTCH1Q13635 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PTCH1Q13635 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTCH1Q13635 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTCH1Q13635 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTCH1Q13635 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
PTCH1Q13635 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTCH1Q13635 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTCH1Q13635 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTCH1Q13635 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTCH1Q13635 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTCH1Q13635 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTCH1Q13635 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTCH1Q13635 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTCH1Q13635 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTCH1Q13635 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTCH1Q13635 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
PTCH1Q13635 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTCH1Q13635 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
PTCH1Q13635 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
PTCH1Q13635 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PTCH1Q13635 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PTCH1Q13635 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PTCH1Q13635 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PTCH1Q13635 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
PTCH1Q13635 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.53
PTCH1Q13635 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.53
PTCH1Q13635 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.53
PTCH1Q13635 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
PTCH1Q13635 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTCH1Q13635 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTCH1Q13635 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTCH1Q13635 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTCH1Q13635 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTCH1Q13635 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTCH1Q13635 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTCH1Q13635 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTCH1Q13635 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTCH1Q13635 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTCH1Q13635 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTCH1Q13635 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTCH1Q13635 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
PTCH1Q13635 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PTCH1Q13635 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PTCH1Q13635 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PTCH1Q13635 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTCH1Q13635 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTCH1Q13635 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
PTCH1Q13635 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
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