Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

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Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTMR3Q13615 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
MTMR3Q13615 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTMR3Q13615 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTMR3Q13615 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTMR3Q13615 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTMR3Q13615 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTMR3Q13615 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTMR3Q13615 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
MTMR3Q13615 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTMR3Q13615 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTMR3Q13615 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTMR3Q13615 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTMR3Q13615 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
MTMR3Q13615 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTMR3Q13615 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTMR3Q13615 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTMR3Q13615 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTMR3Q13615 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTMR3Q13615 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTMR3Q13615 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTMR3Q13615 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTMR3Q13615 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTMR3Q13615 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
MTMR3Q13615 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTMR3Q13615 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTMR3Q13615 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTMR3Q13615 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTMR3Q13615 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTMR3Q13615 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTMR3Q13615 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTMR3Q13615 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTMR3Q13615 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTMR3Q13615 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTMR3Q13615 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTMR3Q13615 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
MTMR3Q13615 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTMR3Q13615 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTMR3Q13615 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTMR3Q13615 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTMR3Q13615 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTMR3Q13615 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTMR3Q13615 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
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