Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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