Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF4BQ13523 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF4BQ13523 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF4BQ13523 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF4BQ13523 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF4BQ13523 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF4BQ13523 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF4BQ13523 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF4BQ13523 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF4BQ13523 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF4BQ13523 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF4BQ13523 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF4BQ13523 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF4BQ13523 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF4BQ13523 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF4BQ13523 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF4BQ13523 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF4BQ13523 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF4BQ13523 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF4BQ13523 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF4BQ13523 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF4BQ13523 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF4BQ13523 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF4BQ13523 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF4BQ13523 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF4BQ13523 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF4BQ13523 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF4BQ13523 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF4BQ13523 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF4BQ13523 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF4BQ13523 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF4BQ13523 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF4BQ13523 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF4BQ13523 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF4BQ13523 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF4BQ13523 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF4BQ13523 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF4BQ13523 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF4BQ13523 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF4BQ13523 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF4BQ13523 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF4BQ13523 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF4BQ13523 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF4BQ13523 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF4BQ13523 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF4BQ13523 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF4BQ13523 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF4BQ13523 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF4BQ13523 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF4BQ13523 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF4BQ13523 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF4BQ13523 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF4BQ13523 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF4BQ13523 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF4BQ13523 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF4BQ13523 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF4BQ13523 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF4BQ13523 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF4BQ13523 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF4BQ13523 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF4BQ13523 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF4BQ13523 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF4BQ13523 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF4BQ13523 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF4BQ13523 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF4BQ13523 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF4BQ13523 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF4BQ13523 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF4BQ13523 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF4BQ13523 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF4BQ13523 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF4BQ13523 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF4BQ13523 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF4BQ13523 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF4BQ13523 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF4BQ13523 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF4BQ13523 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF4BQ13523 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF4BQ13523 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF4BQ13523 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF4BQ13523 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF4BQ13523 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF4BQ13523 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF4BQ13523 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF4BQ13523 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF4BQ13523 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF4BQ13523 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF4BQ13523 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF4BQ13523 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF4BQ13523 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF4BQ13523 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF4BQ13523 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF4BQ13523 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF4BQ13523 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF4BQ13523 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF4BQ13523 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF4BQ13523 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF4BQ13523 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF4BQ13523 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF4BQ13523 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
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