Protein–RNA interactions for Protein: Q13507

TRPC3, Short transient receptor potential channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC3Q13507 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRPC3Q13507 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TRPC3Q13507 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TRPC3Q13507 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRPC3Q13507 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRPC3Q13507 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRPC3Q13507 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRPC3Q13507 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRPC3Q13507 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRPC3Q13507 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRPC3Q13507 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRPC3Q13507 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRPC3Q13507 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRPC3Q13507 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRPC3Q13507 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRPC3Q13507 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TRPC3Q13507 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRPC3Q13507 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TRPC3Q13507 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRPC3Q13507 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRPC3Q13507 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRPC3Q13507 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRPC3Q13507 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRPC3Q13507 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRPC3Q13507 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRPC3Q13507 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRPC3Q13507 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRPC3Q13507 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRPC3Q13507 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TRPC3Q13507 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TRPC3Q13507 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRPC3Q13507 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRPC3Q13507 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRPC3Q13507 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRPC3Q13507 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRPC3Q13507 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRPC3Q13507 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRPC3Q13507 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRPC3Q13507 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRPC3Q13507 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRPC3Q13507 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRPC3Q13507 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRPC3Q13507 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRPC3Q13507 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRPC3Q13507 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRPC3Q13507 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRPC3Q13507 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRPC3Q13507 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRPC3Q13507 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRPC3Q13507 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRPC3Q13507 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TRPC3Q13507 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TRPC3Q13507 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TRPC3Q13507 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRPC3Q13507 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TRPC3Q13507 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRPC3Q13507 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRPC3Q13507 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRPC3Q13507 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRPC3Q13507 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRPC3Q13507 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRPC3Q13507 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRPC3Q13507 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRPC3Q13507 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRPC3Q13507 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TRPC3Q13507 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRPC3Q13507 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRPC3Q13507 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRPC3Q13507 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRPC3Q13507 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRPC3Q13507 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRPC3Q13507 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRPC3Q13507 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRPC3Q13507 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TRPC3Q13507 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRPC3Q13507 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRPC3Q13507 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRPC3Q13507 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRPC3Q13507 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRPC3Q13507 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRPC3Q13507 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRPC3Q13507 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRPC3Q13507 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRPC3Q13507 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TRPC3Q13507 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRPC3Q13507 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRPC3Q13507 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRPC3Q13507 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRPC3Q13507 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TRPC3Q13507 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TRPC3Q13507 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRPC3Q13507 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRPC3Q13507 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRPC3Q13507 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRPC3Q13507 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
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