Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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