Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGB3BPQ13352 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGB3BPQ13352 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGB3BPQ13352 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGB3BPQ13352 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGB3BPQ13352 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGB3BPQ13352 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGB3BPQ13352 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGB3BPQ13352 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGB3BPQ13352 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGB3BPQ13352 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGB3BPQ13352 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGB3BPQ13352 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGB3BPQ13352 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGB3BPQ13352 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGB3BPQ13352 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGB3BPQ13352 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGB3BPQ13352 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGB3BPQ13352 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGB3BPQ13352 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGB3BPQ13352 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGB3BPQ13352 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGB3BPQ13352 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGB3BPQ13352 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGB3BPQ13352 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGB3BPQ13352 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGB3BPQ13352 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGB3BPQ13352 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGB3BPQ13352 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGB3BPQ13352 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGB3BPQ13352 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGB3BPQ13352 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGB3BPQ13352 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGB3BPQ13352 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGB3BPQ13352 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGB3BPQ13352 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGB3BPQ13352 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGB3BPQ13352 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
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