Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEMA3FQ13275 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEMA3FQ13275 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEMA3FQ13275 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEMA3FQ13275 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEMA3FQ13275 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEMA3FQ13275 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEMA3FQ13275 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEMA3FQ13275 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEMA3FQ13275 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEMA3FQ13275 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SEMA3FQ13275 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SEMA3FQ13275 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SEMA3FQ13275 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEMA3FQ13275 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEMA3FQ13275 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEMA3FQ13275 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEMA3FQ13275 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SEMA3FQ13275 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SEMA3FQ13275 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SEMA3FQ13275 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEMA3FQ13275 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEMA3FQ13275 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEMA3FQ13275 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEMA3FQ13275 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEMA3FQ13275 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEMA3FQ13275 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEMA3FQ13275 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEMA3FQ13275 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEMA3FQ13275 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEMA3FQ13275 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SEMA3FQ13275 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEMA3FQ13275 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEMA3FQ13275 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEMA3FQ13275 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEMA3FQ13275 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEMA3FQ13275 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEMA3FQ13275 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEMA3FQ13275 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEMA3FQ13275 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEMA3FQ13275 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEMA3FQ13275 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEMA3FQ13275 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEMA3FQ13275 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEMA3FQ13275 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEMA3FQ13275 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEMA3FQ13275 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEMA3FQ13275 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEMA3FQ13275 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEMA3FQ13275 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEMA3FQ13275 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEMA3FQ13275 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEMA3FQ13275 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEMA3FQ13275 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEMA3FQ13275 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEMA3FQ13275 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEMA3FQ13275 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEMA3FQ13275 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEMA3FQ13275 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEMA3FQ13275 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEMA3FQ13275 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEMA3FQ13275 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEMA3FQ13275 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEMA3FQ13275 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEMA3FQ13275 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEMA3FQ13275 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEMA3FQ13275 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEMA3FQ13275 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEMA3FQ13275 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEMA3FQ13275 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEMA3FQ13275 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEMA3FQ13275 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEMA3FQ13275 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEMA3FQ13275 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEMA3FQ13275 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEMA3FQ13275 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEMA3FQ13275 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEMA3FQ13275 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEMA3FQ13275 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEMA3FQ13275 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEMA3FQ13275 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEMA3FQ13275 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEMA3FQ13275 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEMA3FQ13275 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEMA3FQ13275 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEMA3FQ13275 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEMA3FQ13275 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SEMA3FQ13275 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEMA3FQ13275 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEMA3FQ13275 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEMA3FQ13275 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEMA3FQ13275 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEMA3FQ13275 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEMA3FQ13275 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SEMA3FQ13275 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEMA3FQ13275 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEMA3FQ13275 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SEMA3FQ13275 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SEMA3FQ13275 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SEMA3FQ13275 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
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