Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 AGPAT3-213ENST00000479117 1510 ntTSL 516.42■□□□□ 0.223e-7■■■■■ 29.3
TARDBPQ13148 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.344e-8■■■■■ 29.3
TARDBPQ13148 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.284e-8■■■■■ 29.3
TARDBPQ13148 ARVCF-206ENST00000467828 258 ntTSL 319.21■□□□□ 0.674e-8■■■■■ 29.3
TARDBPQ13148 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 04e-8■■■■■ 29.3
TARDBPQ13148 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.35e-14■■■■■ 29.3
TARDBPQ13148 SERBP1-203ENST00000370994 6676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.052e-19■■■■■ 29.3
TARDBPQ13148 AHCTF1-202ENST00000366508 8751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.695e-8■■■■■ 29.3
TARDBPQ13148 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.625e-8■■■■■ 29.3
TARDBPQ13148 AHCTF1-203ENST00000470300 7041 ntTSL 1 (best)1.44□□□□□ -2.185e-8■■■■■ 29.3
TARDBPQ13148 MED27-203ENST00000444872 433 ntTSL 513.91□□□□□ -0.181e-6■■■■■ 29.3
TARDBPQ13148 MED27-202ENST00000357028 1281 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.371e-6■■■■■ 29.3
TARDBPQ13148 MED27-201ENST00000292035 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.461e-6■■■■■ 29.3
TARDBPQ13148 MIR4435-2HG-212ENST00000444301 666 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.721e-7■■■■■ 29.2
TARDBPQ13148 MIR4435-2HG-214ENST00000453478 560 ntTSL 4 BASIC7.88□□□□□ -1.151e-7■■■■■ 29.2
TARDBPQ13148 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.22e-8■■■■■ 29.2
TARDBPQ13148 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.152e-8■■■■■ 29.2
TARDBPQ13148 SOD2-203ENST00000367055 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.762e-8■■■■■ 29.2
TARDBPQ13148 SOD2-216ENST00000546260 4302 ntTSL 510.23□□□□□ -0.772e-8■■■■■ 29.2
TARDBPQ13148 SOD2-211ENST00000538183 14266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.252e-8■■■■■ 29.2
TARDBPQ13148 SGMS1-204ENST00000492601 625 ntTSL 1 (best)17.51■□□□□ 0.398e-7■■■■■ 29.1
TARDBPQ13148 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.232e-6■■■■■ 29.1
TARDBPQ13148 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC5.54□□□□□ -1.522e-6■■■■■ 29.1
TARDBPQ13148 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.411e-6■■■■■ 29.1
TARDBPQ13148 MAN2A1-202ENST00000502261 448 ntTSL 54.19□□□□□ -1.741e-6■■■■■ 29.1
TARDBPQ13148 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.361e-8■■■■■ 29.1
TARDBPQ13148 AKR1C1-202ENST00000380872 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.131e-8■■■■■ 29.1
TARDBPQ13148 ATP13A3-202ENST00000429136 3729 ntTSL 1 (best)5.15□□□□□ -1.581e-7■■■■■ 29.1
TARDBPQ13148 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.661e-7■■■■■ 29.1
TARDBPQ13148 MYO18A-222ENST00000590565 261 ntTSL 32.81□□□□□ -1.961e-8■■■■■ 29.1
TARDBPQ13148 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.11e-7■■■■■ 29.1
TARDBPQ13148 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.259e-8■■■■■ 29.1
TARDBPQ13148 CLCN6-206ENST00000376496 2922 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.549e-8■■■■■ 29.1
TARDBPQ13148 CLCN6-202ENST00000346436 5583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.759e-8■■■■■ 29.1
TARDBPQ13148 CLCN6-208ENST00000494028 773 ntTSL 59.9□□□□□ -0.829e-8■■■■■ 29.1
TARDBPQ13148 HSPG2-208ENST00000471322 1602 ntTSL 516.58■□□□□ 0.242e-6■■■■■ 29
TARDBPQ13148 HSPG2-203ENST00000374695 14327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.091e-6■■■■■ 29
TARDBPQ13148 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.414e-8■■■■■ 29
TARDBPQ13148 TAB2-202ENST00000461481 524 ntTSL 313.89□□□□□ -0.194e-8■■■■■ 29
TARDBPQ13148 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.214e-8■■■■■ 29
TARDBPQ13148 TAB2-207ENST00000606797 677 ntTSL 57.78□□□□□ -1.164e-8■■■■■ 29
TARDBPQ13148 TAB2-206ENST00000606202 648 ntTSL 44.81□□□□□ -1.644e-8■■■■■ 29
TARDBPQ13148 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.044e-8■■■■■ 29
TARDBPQ13148 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.321e-6■■■■■ 29
TARDBPQ13148 ERICH1-202ENST00000518277 788 ntTSL 216.42■□□□□ 0.221e-6■■■■■ 29
TARDBPQ13148 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.331e-6■■■■■ 29
TARDBPQ13148 PRKAR2B-202ENST00000393613 642 ntTSL 36.3□□□□□ -1.44e-16■■■■■ 29
TARDBPQ13148 PRKAR2B-203ENST00000488792 609 ntTSL 34.8□□□□□ -1.644e-16■■■■■ 29
TARDBPQ13148 ELF2-209ENST00000511184 1766 ntTSL 526.3■■□□□ 1.84e-9■■■■■ 29
TARDBPQ13148 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.773e-17■■■■■ 29
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TARDBPQ13148 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.713e-17■■■■■ 29
TARDBPQ13148 C17orf62-208ENST00000577696 656 ntTSL 419.45■□□□□ 0.73e-17■■■■■ 29
TARDBPQ13148 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.643e-7■■■■■ 29
TARDBPQ13148 PLCD1-205ENST00000473834 545 ntTSL 418.98■□□□□ 0.633e-7■■■■■ 29
TARDBPQ13148 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.583e-17■■■■■ 29
TARDBPQ13148 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.563e-17■■■■■ 29
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TARDBPQ13148 C17orf62-217ENST00000578941 1079 ntTSL 1 (best)18.05■□□□□ 0.483e-17■■■■■ 29
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TARDBPQ13148 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.273e-17■■■■■ 29
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TARDBPQ13148 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.23e-17■■■■■ 29
TARDBPQ13148 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.194e-9■■■■■ 29
TARDBPQ13148 C17orf62-209ENST00000577707 534 ntTSL 415.91■□□□□ 0.143e-17■■■■■ 29
TARDBPQ13148 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.123e-17■■■■■ 29
TARDBPQ13148 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.093e-17■■■■■ 29
TARDBPQ13148 C17orf62-212ENST00000577888 617 ntTSL 215.6■□□□□ 0.093e-17■■■■■ 29
TARDBPQ13148 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.024e-9■■■■■ 29
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TARDBPQ13148 AC068205.2-202ENST00000636894 2134 nt15.15■□□□□ 0.021e-8■■■■■ 29
TARDBPQ13148 CLCN7-214ENST00000569851 1014 ntTSL 515.06■□□□□ 04e-9■■■■■ 29
TARDBPQ13148 CLCN7-206ENST00000563822 851 ntTSL 514.74□□□□□ -0.054e-9■■■■■ 29
TARDBPQ13148 C17orf62-235ENST00000584791 559 ntTSL 214.73□□□□□ -0.053e-17■■■■■ 29
TARDBPQ13148 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.134e-9■■■■■ 29
TARDBPQ13148 PLCD1-203ENST00000461445 3271 ntTSL 213.7□□□□□ -0.223e-7■■■■■ 29
TARDBPQ13148 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.223e-17■■■■■ 29
TARDBPQ13148 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.243e-7■■■■■ 29
TARDBPQ13148 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.274e-9■■■■■ 29
TARDBPQ13148 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.34e-9■■■■■ 29
TARDBPQ13148 C17orf62-234ENST00000584503 584 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.393e-17■■■■■ 29
TARDBPQ13148 C17orf62-233ENST00000584408 497 ntTSL 411.34□□□□□ -0.593e-17■■■■■ 29
TARDBPQ13148 C17orf62-215ENST00000578913 563 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.673e-17■■■■■ 29
TARDBPQ13148 C17orf62-231ENST00000583778 481 ntTSL 210.89□□□□□ -0.673e-17■■■■■ 29
TARDBPQ13148 C17orf62-211ENST00000577834 540 ntTSL 410.39□□□□□ -0.753e-17■■■■■ 29
TARDBPQ13148 AC020904.2-201ENST00000621646 1669 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.764e-9■■■■■ 29
TARDBPQ13148 AC068205.2-203ENST00000529261 748 ntTSL 310.28□□□□□ -0.761e-8■■■■■ 29
TARDBPQ13148 C17orf62-220ENST00000580560 564 ntTSL 4 BASIC10.03□□□□□ -0.83e-17■■■■■ 29
TARDBPQ13148 AC068205.1-201ENST00000526615 689 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.951e-8■■■■■ 29
TARDBPQ13148 AC068205.1-202ENST00000533358 475 ntTSL 59.09□□□□□ -0.951e-8■■■■■ 29
TARDBPQ13148 PFKFB3-218ENST00000639949 587 ntTSL 48.78□□□□□ -14e-9■■■■■ 29
TARDBPQ13148 C17orf62-236ENST00000584891 468 ntTSL 38.41□□□□□ -1.063e-17■■■■■ 29
TARDBPQ13148 AC068205.2-201ENST00000532864 771 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.271e-8■■■■■ 29
TARDBPQ13148 FAM126A-209ENST00000498833 638 ntTSL 36□□□□□ -1.454e-9■■■■■ 29
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