Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RESTQ13127 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RESTQ13127 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RESTQ13127 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RESTQ13127 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RESTQ13127 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RESTQ13127 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RESTQ13127 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RESTQ13127 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RESTQ13127 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RESTQ13127 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RESTQ13127 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RESTQ13127 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RESTQ13127 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RESTQ13127 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RESTQ13127 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RESTQ13127 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RESTQ13127 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RESTQ13127 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RESTQ13127 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RESTQ13127 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RESTQ13127 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RESTQ13127 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RESTQ13127 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RESTQ13127 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RESTQ13127 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RESTQ13127 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RESTQ13127 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RESTQ13127 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RESTQ13127 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RESTQ13127 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RESTQ13127 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RESTQ13127 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RESTQ13127 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RESTQ13127 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RESTQ13127 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RESTQ13127 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RESTQ13127 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RESTQ13127 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RESTQ13127 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RESTQ13127 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RESTQ13127 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RESTQ13127 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RESTQ13127 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RESTQ13127 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RESTQ13127 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RESTQ13127 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RESTQ13127 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RESTQ13127 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RESTQ13127 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RESTQ13127 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RESTQ13127 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RESTQ13127 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RESTQ13127 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RESTQ13127 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RESTQ13127 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RESTQ13127 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RESTQ13127 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RESTQ13127 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RESTQ13127 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RESTQ13127 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RESTQ13127 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RESTQ13127 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RESTQ13127 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RESTQ13127 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RESTQ13127 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RESTQ13127 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RESTQ13127 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RESTQ13127 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RESTQ13127 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RESTQ13127 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RESTQ13127 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RESTQ13127 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RESTQ13127 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RESTQ13127 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RESTQ13127 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RESTQ13127 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RESTQ13127 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RESTQ13127 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RESTQ13127 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RESTQ13127 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RESTQ13127 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RESTQ13127 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RESTQ13127 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RESTQ13127 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RESTQ13127 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RESTQ13127 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RESTQ13127 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RESTQ13127 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RESTQ13127 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RESTQ13127 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RESTQ13127 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RESTQ13127 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RESTQ13127 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RESTQ13127 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RESTQ13127 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RESTQ13127 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RESTQ13127 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RESTQ13127 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RESTQ13127 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
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