Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NFX1Q12986 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFX1Q12986 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFX1Q12986 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFX1Q12986 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFX1Q12986 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFX1Q12986 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NFX1Q12986 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NFX1Q12986 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NFX1Q12986 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
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