Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BNIP1Q12981 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BNIP1Q12981 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BNIP1Q12981 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BNIP1Q12981 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BNIP1Q12981 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BNIP1Q12981 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BNIP1Q12981 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BNIP1Q12981 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BNIP1Q12981 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BNIP1Q12981 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BNIP1Q12981 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.33■■□□□ 1
BNIP1Q12981 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
BNIP1Q12981 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
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