Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTP4A2Q12974 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PTP4A2Q12974 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTP4A2Q12974 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTP4A2Q12974 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTP4A2Q12974 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PTP4A2Q12974 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTP4A2Q12974 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PTP4A2Q12974 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTP4A2Q12974 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTP4A2Q12974 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTP4A2Q12974 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PTP4A2Q12974 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTP4A2Q12974 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTP4A2Q12974 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTP4A2Q12974 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTP4A2Q12974 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTP4A2Q12974 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTP4A2Q12974 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTP4A2Q12974 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTP4A2Q12974 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTP4A2Q12974 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTP4A2Q12974 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTP4A2Q12974 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTP4A2Q12974 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTP4A2Q12974 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTP4A2Q12974 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTP4A2Q12974 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PTP4A2Q12974 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTP4A2Q12974 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTP4A2Q12974 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTP4A2Q12974 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTP4A2Q12974 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTP4A2Q12974 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTP4A2Q12974 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTP4A2Q12974 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTP4A2Q12974 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTP4A2Q12974 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTP4A2Q12974 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTP4A2Q12974 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTP4A2Q12974 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTP4A2Q12974 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTP4A2Q12974 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTP4A2Q12974 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTP4A2Q12974 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTP4A2Q12974 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTP4A2Q12974 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTP4A2Q12974 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTP4A2Q12974 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTP4A2Q12974 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTP4A2Q12974 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTP4A2Q12974 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTP4A2Q12974 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTP4A2Q12974 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTP4A2Q12974 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTP4A2Q12974 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTP4A2Q12974 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTP4A2Q12974 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTP4A2Q12974 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTP4A2Q12974 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTP4A2Q12974 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTP4A2Q12974 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTP4A2Q12974 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTP4A2Q12974 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTP4A2Q12974 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTP4A2Q12974 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PTP4A2Q12974 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTP4A2Q12974 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTP4A2Q12974 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTP4A2Q12974 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTP4A2Q12974 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTP4A2Q12974 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTP4A2Q12974 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PTP4A2Q12974 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTP4A2Q12974 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTP4A2Q12974 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTP4A2Q12974 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTP4A2Q12974 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PTP4A2Q12974 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTP4A2Q12974 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTP4A2Q12974 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTP4A2Q12974 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTP4A2Q12974 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTP4A2Q12974 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTP4A2Q12974 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTP4A2Q12974 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTP4A2Q12974 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTP4A2Q12974 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTP4A2Q12974 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PTP4A2Q12974 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTP4A2Q12974 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTP4A2Q12974 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTP4A2Q12974 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTP4A2Q12974 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTP4A2Q12974 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTP4A2Q12974 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTP4A2Q12974 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTP4A2Q12974 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTP4A2Q12974 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTP4A2Q12974 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
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