Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
HMGXB3Q12766 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
HMGXB3Q12766 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
HMGXB3Q12766 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC39.5■■■■□ 3.91
HMGXB3Q12766 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
HMGXB3Q12766 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
HMGXB3Q12766 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
HMGXB3Q12766 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC39.49■■■■□ 3.91
HMGXB3Q12766 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.48■■■■□ 3.91
HMGXB3Q12766 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
HMGXB3Q12766 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC39.48■■■■□ 3.91
HMGXB3Q12766 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC39.48■■■■□ 3.91
HMGXB3Q12766 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.48■■■■□ 3.91
HMGXB3Q12766 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
HMGXB3Q12766 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.47■■■■□ 3.91
HMGXB3Q12766 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
HMGXB3Q12766 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC39.47■■■■□ 3.91
HMGXB3Q12766 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
HMGXB3Q12766 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC39.47■■■■□ 3.91
HMGXB3Q12766 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC39.47■■■■□ 3.91
HMGXB3Q12766 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
HMGXB3Q12766 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
HMGXB3Q12766 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC39.46■■■■□ 3.91
HMGXB3Q12766 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
HMGXB3Q12766 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
HMGXB3Q12766 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
HMGXB3Q12766 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
HMGXB3Q12766 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
HMGXB3Q12766 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
HMGXB3Q12766 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
HMGXB3Q12766 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC39.45■■■■□ 3.91
HMGXB3Q12766 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.91
HMGXB3Q12766 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
HMGXB3Q12766 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.44■■■■□ 3.9
HMGXB3Q12766 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
HMGXB3Q12766 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC39.44■■■■□ 3.9
HMGXB3Q12766 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.44■■■■□ 3.9
HMGXB3Q12766 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
HMGXB3Q12766 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
HMGXB3Q12766 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC39.44■■■■□ 3.9
HMGXB3Q12766 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
HMGXB3Q12766 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
HMGXB3Q12766 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.44■■■■□ 3.9
HMGXB3Q12766 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC39.44■■■■□ 3.9
HMGXB3Q12766 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC39.44■■■■□ 3.9
HMGXB3Q12766 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
HMGXB3Q12766 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.43■■■■□ 3.9
HMGXB3Q12766 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC39.43■■■■□ 3.9
HMGXB3Q12766 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC39.43■■■■□ 3.9
HMGXB3Q12766 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
HMGXB3Q12766 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
HMGXB3Q12766 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC39.42■■■■□ 3.9
HMGXB3Q12766 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
HMGXB3Q12766 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
HMGXB3Q12766 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC39.41■■■■□ 3.9
HMGXB3Q12766 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
HMGXB3Q12766 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
HMGXB3Q12766 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
HMGXB3Q12766 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC39.4■■■■□ 3.9
HMGXB3Q12766 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
HMGXB3Q12766 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
HMGXB3Q12766 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
HMGXB3Q12766 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
HMGXB3Q12766 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.4■■■■□ 3.9
HMGXB3Q12766 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
HMGXB3Q12766 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
HMGXB3Q12766 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
HMGXB3Q12766 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
HMGXB3Q12766 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
HMGXB3Q12766 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
HMGXB3Q12766 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.39■■■■□ 3.9
HMGXB3Q12766 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.9
HMGXB3Q12766 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
HMGXB3Q12766 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC39.38■■■■□ 3.89
HMGXB3Q12766 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.89
HMGXB3Q12766 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.37■■■■□ 3.89
HMGXB3Q12766 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC39.37■■■■□ 3.89
HMGXB3Q12766 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
HMGXB3Q12766 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC39.37■■■■□ 3.89
HMGXB3Q12766 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC39.37■■■■□ 3.89
HMGXB3Q12766 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC39.37■■■■□ 3.89
HMGXB3Q12766 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
HMGXB3Q12766 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
HMGXB3Q12766 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
HMGXB3Q12766 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC39.36■■■■□ 3.89
HMGXB3Q12766 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
HMGXB3Q12766 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
HMGXB3Q12766 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
HMGXB3Q12766 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
HMGXB3Q12766 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
HMGXB3Q12766 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
HMGXB3Q12766 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC39.35■■■■□ 3.89
HMGXB3Q12766 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC39.35■■■■□ 3.89
HMGXB3Q12766 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
HMGXB3Q12766 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
HMGXB3Q12766 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
HMGXB3Q12766 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.35■■■■□ 3.89
HMGXB3Q12766 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC39.35■■■■□ 3.89
HMGXB3Q12766 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC39.35■■■■□ 3.89
HMGXB3Q12766 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.35■■■■□ 3.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 450.2 ms