Protein–RNA interactions for Protein: Q12316

TY1B-GR3, Transposon Ty1-GR3 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-GR3Q12316 GEM1YAL048C 1989 nt4.82□□□□□ -1.64
TY1B-GR3Q12316 IKI3YLR384C 4050 nt4.82□□□□□ -1.64
TY1B-GR3Q12316 NAM2YLR382C 2685 nt4.81□□□□□ -1.64
TY1B-GR3Q12316 GPI12YMR281W 915 nt4.81□□□□□ -1.64
TY1B-GR3Q12316 POL31YJR006W 1464 nt4.81□□□□□ -1.64
TY1B-GR3Q12316 EPL1YFL024C 2499 nt4.81□□□□□ -1.64
TY1B-GR3Q12316 ASN1YPR145W 1719 nt4.81□□□□□ -1.64
TY1B-GR3Q12316 BCH1YMR237W 2175 nt4.81□□□□□ -1.64
TY1B-GR3Q12316 IFM1YOL023W 2031 nt4.81□□□□□ -1.64
TY1B-GR3Q12316 MEK1YOR351C 1494 nt4.81□□□□□ -1.64
TY1B-GR3Q12316 RPL23BYER117W 414 nt4.81□□□□□ -1.64
TY1B-GR3Q12316 COA2YPL189C-A 207 nt4.81□□□□□ -1.64
TY1B-GR3Q12316 SSE2YBR169C 2082 nt4.8□□□□□ -1.64
TY1B-GR3Q12316 GPR1YDL035C 2886 nt4.8□□□□□ -1.64
TY1B-GR3Q12316 REE1YJL217W 597 nt4.8□□□□□ -1.64
TY1B-GR3Q12316 RPC37YKR025W 849 nt4.8□□□□□ -1.64
TY1B-GR3Q12316 WRS1YOL097C 1299 nt4.8□□□□□ -1.64
TY1B-GR3Q12316 RPL18AYOL120C 561 nt4.8□□□□□ -1.64
TY1B-GR3Q12316 SSB1YDL229W 1842 nt4.8□□□□□ -1.64
TY1B-GR3Q12316 MTR4YJL050W 3222 nt4.8□□□□□ -1.64
TY1B-GR3Q12316 OSH3YHR073W 2991 nt4.8□□□□□ -1.64
TY1B-GR3Q12316 MSS1YMR023C 1581 nt4.79□□□□□ -1.64
TY1B-GR3Q12316 PRE1YER012W 597 nt4.79□□□□□ -1.64
TY1B-GR3Q12316 ENV9YOR246C 993 nt4.79□□□□□ -1.64
TY1B-GR3Q12316 CHS3YBR023C 3498 nt4.78□□□□□ -1.64
TY1B-GR3Q12316 FAA2YER015W 2235 nt4.78□□□□□ -1.64
TY1B-GR3Q12316 PSE1YMR308C 3270 nt4.77□□□□□ -1.65
TY1B-GR3Q12316 YNL247WYNL247W 2304 nt4.77□□□□□ -1.65
TY1B-GR3Q12316 DOG1YHR044C 741 nt4.77□□□□□ -1.65
TY1B-GR3Q12316 STU2YLR045C 2667 nt4.77□□□□□ -1.65
TY1B-GR3Q12316 MIG3YER028C 1185 nt4.76□□□□□ -1.65
TY1B-GR3Q12316 SEC53YFL045C 765 nt4.76□□□□□ -1.65
TY1B-GR3Q12316 RPB9YGL070C 369 nt4.76□□□□□ -1.65
TY1B-GR3Q12316 NAB6YML117W 3405 nt4.75□□□□□ -1.65
TY1B-GR3Q12316 KCH1YJR054W 1494 nt4.75□□□□□ -1.65
TY1B-GR3Q12316 SFI1YLL003W 2841 nt4.75□□□□□ -1.65
TY1B-GR3Q12316 HER2YMR293C 1395 nt4.75□□□□□ -1.65
TY1B-GR3Q12316 NIT3YLR351C 876 nt4.75□□□□□ -1.65
TY1B-GR3Q12316 RPL36BYPL249C-A 303 nt4.75□□□□□ -1.65
TY1B-GR3Q12316 YAK1YJL141C 2424 nt4.75□□□□□ -1.65
TY1B-GR3Q12316 YGR266WYGR266W 2106 nt4.75□□□□□ -1.65
TY1B-GR3Q12316 VPS64YDR200C 1815 nt4.74□□□□□ -1.65
TY1B-GR3Q12316 STV1YMR054W 2673 nt4.74□□□□□ -1.65
TY1B-GR3Q12316 YOL107WYOL107W 1029 nt4.74□□□□□ -1.65
TY1B-GR3Q12316 ITC1YGL133W 3795 nt4.74□□□□□ -1.65
TY1B-GR3Q12316 FAA3YIL009W 2085 nt4.74□□□□□ -1.65
TY1B-GR3Q12316 PAP2YOL115W 1755 nt4.74□□□□□ -1.65
TY1B-GR3Q12316 VPS41YDR080W 2979 nt4.73□□□□□ -1.65
TY1B-GR3Q12316 YMR135W-AYMR135W-A 534 nt4.73□□□□□ -1.65
TY1B-GR3Q12316 RPS12YOR369C 432 nt4.73□□□□□ -1.65
TY1B-GR3Q12316 GAL11YOL051W 3246 nt4.73□□□□□ -1.65
TY1B-GR3Q12316 STR2YJR130C 1920 nt4.72□□□□□ -1.65
TY1B-GR3Q12316 HBT1YDL223C 3141 nt4.72□□□□□ -1.65
TY1B-GR3Q12316 VTH1YIL173W 4650 nt4.72□□□□□ -1.65
TY1B-GR3Q12316 VTH2YJL222W 4650 nt4.72□□□□□ -1.65
TY1B-GR3Q12316 LCL2YLR104W 396 nt4.72□□□□□ -1.65
TY1B-GR3Q12316 YPL260WYPL260W 1656 nt4.72□□□□□ -1.65
TY1B-GR3Q12316 GAS4YOL132W 1416 nt4.72□□□□□ -1.65
TY1B-GR3Q12316 RPN3YER021W 1572 nt4.72□□□□□ -1.65
TY1B-GR3Q12316 TLC1TLC1 1301 nt4.71□□□□□ -1.65
TY1B-GR3Q12316 MUP3YHL036W 1641 nt4.71□□□□□ -1.66
TY1B-GR3Q12316 PPH3YDR075W 927 nt4.7□□□□□ -1.66
TY1B-GR3Q12316 CBT1YKL208W 816 nt4.7□□□□□ -1.66
TY1B-GR3Q12316 YLR257WYLR257W 966 nt4.7□□□□□ -1.66
TY1B-GR3Q12316 PRP43YGL120C 2304 nt4.7□□□□□ -1.66
TY1B-GR3Q12316 AVT7YIL088C 1473 nt4.7□□□□□ -1.66
TY1B-GR3Q12316 VTC4YJL012C 2166 nt4.7□□□□□ -1.66
TY1B-GR3Q12316 STE6YKL209C 3873 nt4.7□□□□□ -1.66
TY1B-GR3Q12316 GIS2YNL255C 462 nt4.7□□□□□ -1.66
TY1B-GR3Q12316 ALA1YOR335C 2877 nt4.7□□□□□ -1.66
TY1B-GR3Q12316 XRS2YDR369C 2565 nt4.69□□□□□ -1.66
TY1B-GR3Q12316 SUP45YBR143C 1314 nt4.69□□□□□ -1.66
TY1B-GR3Q12316 HOT1YMR172W 2160 nt4.69□□□□□ -1.66
TY1B-GR3Q12316 YHR069C-AYHR069C-A 363 nt4.69□□□□□ -1.66
TY1B-GR3Q12316 PAU23YLR037C 375 nt4.69□□□□□ -1.66
TY1B-GR3Q12316 REC8YPR007C 2043 nt4.69□□□□□ -1.66
TY1B-GR3Q12316 ASI1YMR119W 1875 nt4.69□□□□□ -1.66
TY1B-GR3Q12316 GPI14YJR013W 1212 nt4.68□□□□□ -1.66
TY1B-GR3Q12316 YKL107WYKL107W 930 nt4.68□□□□□ -1.66
TY1B-GR3Q12316 YPR108W-AYPR108W-A 213 nt4.68□□□□□ -1.66
TY1B-GR3Q12316 YDL176WYDL176W 2127 nt4.67□□□□□ -1.66
TY1B-GR3Q12316 YGL074CYGL074C 327 nt4.67□□□□□ -1.66
TY1B-GR3Q12316 BCD1YHR040W 1101 nt4.67□□□□□ -1.66
TY1B-GR3Q12316 YAL004WYAL004W 648 nt4.66□□□□□ -1.66
TY1B-GR3Q12316 NNK1YKL171W 2787 nt4.66□□□□□ -1.66
TY1B-GR3Q12316 GPI10YGL142C 1851 nt4.66□□□□□ -1.66
TY1B-GR3Q12316 TIP20YGL145W 2106 nt4.66□□□□□ -1.66
TY1B-GR3Q12316 SKI6YGR195W 741 nt4.65□□□□□ -1.66
TY1B-GR3Q12316 CCW14YLR390W-A 717 nt4.65□□□□□ -1.66
TY1B-GR3Q12316 YDR526CYDR526C 471 nt4.65□□□□□ -1.67
TY1B-GR3Q12316 TIF4632YGL049C 2745 nt4.64□□□□□ -1.67
TY1B-GR3Q12316 YJR085CYJR085C 318 nt4.64□□□□□ -1.67
TY1B-GR3Q12316 CDC40YDR364C 1368 nt4.64□□□□□ -1.67
TY1B-GR3Q12316 GRC3YLL035W 1899 nt4.64□□□□□ -1.67
TY1B-GR3Q12316 YPL276WYPL276W 438 nt4.63□□□□□ -1.67
TY1B-GR3Q12316 GUP1YGL084C 1683 nt4.63□□□□□ -1.67
TY1B-GR3Q12316 MDN1YLR106C 14733 nt4.63□□□□□ -1.67
TY1B-GR3Q12316 YOL153CYOL153C 1746 nt4.63□□□□□ -1.67
TY1B-GR3Q12316 GFA1YKL104C 2154 nt4.63□□□□□ -1.67
TY1B-GR3Q12316 RDI1YDL135C 609 nt4.63□□□□□ -1.67
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