Protein–RNA interactions for Protein: Q12200

NCR1, NPC intracellular cholesterol transporter 1-related protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NCR1Q12200 YER134CYER134C 537 nt7.42□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 COX13YGL191W 390 nt7.42□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 TIM21YGR033C 720 nt7.42□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 YJR037WYJR037W 384 nt7.42□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 YMR252CYMR252C 405 nt7.42□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 MCK1YNL307C 1128 nt7.42□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 GCY1YOR120W 939 nt7.42□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt7.42□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 LYS21YDL131W 1323 nt7.42□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 FCP1YMR277W 2199 nt7.42□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 YFL040WYFL040W 1623 nt7.41□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 YGL102CYGL102C 429 nt7.41□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 GTR2YGR163W 1026 nt7.41□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 NTG1YAL015C 1200 nt7.41□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 ATG10YLL042C 504 nt7.41□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 YPT53YNL093W 663 nt7.41□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 NSL1YPL233W 651 nt7.41□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 SEC24YIL109C 2781 nt7.41□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 ENB1YOL158C 1821 nt7.41□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 RMD8YFR048W 1989 nt7.4□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 YDL183CYDL183C 963 nt7.4□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 MRPL1YDR116C 858 nt7.4□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 YPT35YHR105W 645 nt7.4□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 YOR008W-BYOR008W-B 102 nt7.4□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 DSS4YPR017C 432 nt7.4□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 MLC2YPR188C 492 nt7.4□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 YBR285WYBR285W 435 nt7.4□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt7.4□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt7.4□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 PSY4YBL046W 1326 nt7.4□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt7.4□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 YCL020WYCL020W 1317 nt7.4□□□□□ -1.22
NCR1Q12200 DRS1YLL008W 2259 nt7.4□□□□□ -1.23
NCR1Q12200 YCK3YER123W 1575 nt7.39□□□□□ -1.23
NCR1Q12200 SUC2YIL162W 1599 nt7.39□□□□□ -1.23
NCR1Q12200 HMO1YDR174W 741 nt7.39□□□□□ -1.23
NCR1Q12200 YDR461C-AYDR461C-A 243 nt7.39□□□□□ -1.23
NCR1Q12200 TMT1YER175C 900 nt7.39□□□□□ -1.23
NCR1Q12200 YFL041W-AYFL041W-A 192 nt7.39□□□□□ -1.23
NCR1Q12200 SPG1YGR236C 288 nt7.39□□□□□ -1.23
NCR1Q12200 ASF1YJL115W 840 nt7.39□□□□□ -1.23
NCR1Q12200 YJR087WYJR087W 351 nt7.39□□□□□ -1.23
NCR1Q12200 YLR297WYLR297W 390 nt7.39□□□□□ -1.23
NCR1Q12200 SEC62YPL094C 825 nt7.39□□□□□ -1.23
NCR1Q12200 MSS116YDR194C 1995 nt7.39□□□□□ -1.23
NCR1Q12200 YHR131CYHR131C 2553 nt7.38□□□□□ -1.23
NCR1Q12200 GET1YGL020C 708 nt7.38□□□□□ -1.23
NCR1Q12200 SDT1YGL224C 843 nt7.38□□□□□ -1.23
NCR1Q12200 MRPL31YKL138C 396 nt7.38□□□□□ -1.23
NCR1Q12200 YKL151CYKL151C 1014 nt7.38□□□□□ -1.23
NCR1Q12200 UBX4YMR067C 1251 nt7.38□□□□□ -1.23
NCR1Q12200 YBL077WYBL077W 432 nt7.38□□□□□ -1.23
NCR1Q12200 VBA5YKR105C 1749 nt7.38□□□□□ -1.23
NCR1Q12200 YHR202WYHR202W 1809 nt7.37□□□□□ -1.23
NCR1Q12200 NHP2YDL208W 471 nt7.37□□□□□ -1.23
NCR1Q12200 RPL12AYEL054C 498 nt7.37□□□□□ -1.23
NCR1Q12200 YGR182CYGR182C 354 nt7.37□□□□□ -1.23
NCR1Q12200 PDX1YGR193C 1233 nt7.37□□□□□ -1.23
NCR1Q12200 ASK1YKL052C 879 nt7.37□□□□□ -1.23
NCR1Q12200 YLL056CYLL056C 897 nt7.37□□□□□ -1.23
NCR1Q12200 YBL094CYBL094C 333 nt7.37□□□□□ -1.23
NCR1Q12200 YBL109WYBL109W 336 nt7.37□□□□□ -1.23
NCR1Q12200 ERP4YOR016C 624 nt7.37□□□□□ -1.23
NCR1Q12200 HPA2YPR193C 471 nt7.37□□□□□ -1.23
NCR1Q12200 YBR096WYBR096W 693 nt7.37□□□□□ -1.23
NCR1Q12200 MRPS5YBR251W 924 nt7.37□□□□□ -1.23
NCR1Q12200 YIG1YPL201C 1386 nt7.36□□□□□ -1.23
NCR1Q12200 SNF12YNR023W 1701 nt7.36□□□□□ -1.23
NCR1Q12200 HMLALPHA1YCL066W 528 nt7.36□□□□□ -1.23
NCR1Q12200 MATALPHA1YCR040W 528 nt7.36□□□□□ -1.23
NCR1Q12200 YER158W-AYER158W-A 216 nt7.36□□□□□ -1.23
NCR1Q12200 CAP2YIL034C 864 nt7.36□□□□□ -1.23
NCR1Q12200 PHS1YJL097W 654 nt7.36□□□□□ -1.23
NCR1Q12200 YKL031WYKL031W 414 nt7.36□□□□□ -1.23
NCR1Q12200 YLR347W-AYLR347W-A 141 nt7.36□□□□□ -1.23
NCR1Q12200 RPL31BYLR406C 342 nt7.36□□□□□ -1.23
NCR1Q12200 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt7.36□□□□□ -1.23
NCR1Q12200 SMX3YPR182W 261 nt7.36□□□□□ -1.23
NCR1Q12200 NOP58YOR310C 1536 nt7.36□□□□□ -1.23
NCR1Q12200 PKP2YGL059W 1476 nt7.36□□□□□ -1.23
NCR1Q12200 MAK5YBR142W 2322 nt7.35□□□□□ -1.23
NCR1Q12200 POB3YML069W 1659 nt7.35□□□□□ -1.23
NCR1Q12200 IRC5YFR038W 2562 nt7.35□□□□□ -1.23
NCR1Q12200 CBP2YHL038C 1893 nt7.35□□□□□ -1.23
NCR1Q12200 YCR101CYCR101C 549 nt7.35□□□□□ -1.23
NCR1Q12200 YER119C-AYER119C-A 372 nt7.35□□□□□ -1.23
NCR1Q12200 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt7.35□□□□□ -1.23
NCR1Q12200 YPL035CYPL035C 348 nt7.35□□□□□ -1.23
NCR1Q12200 ECM31YBR176W 939 nt7.35□□□□□ -1.23
NCR1Q12200 ALD2YMR170C 1521 nt7.35□□□□□ -1.23
NCR1Q12200 DOT1YDR440W 1749 nt7.35□□□□□ -1.23
NCR1Q12200 GAS4YOL132W 1416 nt7.35□□□□□ -1.23
NCR1Q12200 PHR1YOR386W 1698 nt7.35□□□□□ -1.23
NCR1Q12200 HNT1YDL125C 477 nt7.34□□□□□ -1.23
NCR1Q12200 FIN1YDR130C 876 nt7.34□□□□□ -1.23
NCR1Q12200 YDR413CYDR413C 576 nt7.34□□□□□ -1.23
NCR1Q12200 YGL152CYGL152C 678 nt7.34□□□□□ -1.23
NCR1Q12200 YKL102CYKL102C 306 nt7.34□□□□□ -1.23
NCR1Q12200 LOT6YLR011W 576 nt7.34□□□□□ -1.23
NCR1Q12200 DCS1YLR270W 1053 nt7.34□□□□□ -1.23
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