Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAQ4

SMAGP, Small cell adhesion glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAGPQ0VAQ4 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms