Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH3

ACSM2A, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM2AQ08AH3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ACSM2AQ08AH3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACSM2AQ08AH3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACSM2AQ08AH3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACSM2AQ08AH3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACSM2AQ08AH3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACSM2AQ08AH3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACSM2AQ08AH3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACSM2AQ08AH3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACSM2AQ08AH3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACSM2AQ08AH3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACSM2AQ08AH3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACSM2AQ08AH3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACSM2AQ08AH3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACSM2AQ08AH3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACSM2AQ08AH3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACSM2AQ08AH3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACSM2AQ08AH3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACSM2AQ08AH3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACSM2AQ08AH3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACSM2AQ08AH3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACSM2AQ08AH3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACSM2AQ08AH3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACSM2AQ08AH3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACSM2AQ08AH3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACSM2AQ08AH3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACSM2AQ08AH3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACSM2AQ08AH3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACSM2AQ08AH3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACSM2AQ08AH3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACSM2AQ08AH3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACSM2AQ08AH3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ACSM2AQ08AH3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ACSM2AQ08AH3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ACSM2AQ08AH3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ACSM2AQ08AH3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACSM2AQ08AH3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACSM2AQ08AH3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACSM2AQ08AH3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACSM2AQ08AH3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACSM2AQ08AH3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACSM2AQ08AH3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACSM2AQ08AH3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACSM2AQ08AH3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACSM2AQ08AH3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACSM2AQ08AH3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACSM2AQ08AH3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACSM2AQ08AH3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACSM2AQ08AH3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACSM2AQ08AH3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ACSM2AQ08AH3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACSM2AQ08AH3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACSM2AQ08AH3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACSM2AQ08AH3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACSM2AQ08AH3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ACSM2AQ08AH3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACSM2AQ08AH3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACSM2AQ08AH3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACSM2AQ08AH3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACSM2AQ08AH3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ACSM2AQ08AH3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACSM2AQ08AH3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACSM2AQ08AH3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACSM2AQ08AH3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACSM2AQ08AH3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACSM2AQ08AH3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms