Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
GOLGA3Q08378 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
GOLGA3Q08378 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
GOLGA3Q08378 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
GOLGA3Q08378 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
GOLGA3Q08378 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
GOLGA3Q08378 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
GOLGA3Q08378 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
GOLGA3Q08378 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
GOLGA3Q08378 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
GOLGA3Q08378 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
GOLGA3Q08378 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
GOLGA3Q08378 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
GOLGA3Q08378 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
GOLGA3Q08378 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
GOLGA3Q08378 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
GOLGA3Q08378 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
GOLGA3Q08378 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
GOLGA3Q08378 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
GOLGA3Q08378 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
GOLGA3Q08378 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
GOLGA3Q08378 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
GOLGA3Q08378 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
GOLGA3Q08378 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
GOLGA3Q08378 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC35.93■■■■□ 3.34
GOLGA3Q08378 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
GOLGA3Q08378 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
GOLGA3Q08378 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
GOLGA3Q08378 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
GOLGA3Q08378 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
GOLGA3Q08378 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
GOLGA3Q08378 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
GOLGA3Q08378 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
GOLGA3Q08378 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
GOLGA3Q08378 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
GOLGA3Q08378 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
GOLGA3Q08378 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
GOLGA3Q08378 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
GOLGA3Q08378 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
GOLGA3Q08378 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
GOLGA3Q08378 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
GOLGA3Q08378 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
GOLGA3Q08378 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
GOLGA3Q08378 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
GOLGA3Q08378 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
GOLGA3Q08378 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
GOLGA3Q08378 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
GOLGA3Q08378 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
GOLGA3Q08378 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
GOLGA3Q08378 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
GOLGA3Q08378 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
GOLGA3Q08378 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
GOLGA3Q08378 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
GOLGA3Q08378 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
GOLGA3Q08378 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
GOLGA3Q08378 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
GOLGA3Q08378 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC35.9■■■■□ 3.34
GOLGA3Q08378 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
GOLGA3Q08378 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
GOLGA3Q08378 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
GOLGA3Q08378 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
GOLGA3Q08378 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
GOLGA3Q08378 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
GOLGA3Q08378 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
GOLGA3Q08378 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
GOLGA3Q08378 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
GOLGA3Q08378 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
GOLGA3Q08378 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC35.89■■■■□ 3.34
GOLGA3Q08378 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
GOLGA3Q08378 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
GOLGA3Q08378 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
GOLGA3Q08378 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
GOLGA3Q08378 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
GOLGA3Q08378 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
GOLGA3Q08378 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
GOLGA3Q08378 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
GOLGA3Q08378 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
GOLGA3Q08378 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
GOLGA3Q08378 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
GOLGA3Q08378 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
GOLGA3Q08378 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
GOLGA3Q08378 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
GOLGA3Q08378 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
GOLGA3Q08378 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
GOLGA3Q08378 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
GOLGA3Q08378 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
GOLGA3Q08378 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
GOLGA3Q08378 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
GOLGA3Q08378 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
GOLGA3Q08378 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
GOLGA3Q08378 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
GOLGA3Q08378 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
GOLGA3Q08378 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
GOLGA3Q08378 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
GOLGA3Q08378 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
GOLGA3Q08378 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC35.85■■■■□ 3.33
GOLGA3Q08378 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
GOLGA3Q08378 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
GOLGA3Q08378 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
GOLGA3Q08378 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms