Protein–RNA interactions for Protein: Q07912

TNK2, Activated CDC42 kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNK2Q07912 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNK2Q07912 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNK2Q07912 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNK2Q07912 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNK2Q07912 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNK2Q07912 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNK2Q07912 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNK2Q07912 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNK2Q07912 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNK2Q07912 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNK2Q07912 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNK2Q07912 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNK2Q07912 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNK2Q07912 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TNK2Q07912 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNK2Q07912 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TNK2Q07912 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNK2Q07912 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNK2Q07912 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNK2Q07912 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNK2Q07912 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNK2Q07912 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNK2Q07912 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNK2Q07912 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNK2Q07912 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNK2Q07912 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNK2Q07912 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNK2Q07912 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TNK2Q07912 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms