Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDE4BQ07343 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDE4BQ07343 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDE4BQ07343 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDE4BQ07343 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDE4BQ07343 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE4BQ07343 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE4BQ07343 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE4BQ07343 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE4BQ07343 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE4BQ07343 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE4BQ07343 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE4BQ07343 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE4BQ07343 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE4BQ07343 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE4BQ07343 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE4BQ07343 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE4BQ07343 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE4BQ07343 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE4BQ07343 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE4BQ07343 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE4BQ07343 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE4BQ07343 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE4BQ07343 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE4BQ07343 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE4BQ07343 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE4BQ07343 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDE4BQ07343 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDE4BQ07343 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDE4BQ07343 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDE4BQ07343 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDE4BQ07343 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDE4BQ07343 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PDE4BQ07343 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDE4BQ07343 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDE4BQ07343 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDE4BQ07343 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PDE4BQ07343 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PDE4BQ07343 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE4BQ07343 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE4BQ07343 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE4BQ07343 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE4BQ07343 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE4BQ07343 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE4BQ07343 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE4BQ07343 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE4BQ07343 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE4BQ07343 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE4BQ07343 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE4BQ07343 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE4BQ07343 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE4BQ07343 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE4BQ07343 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE4BQ07343 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE4BQ07343 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE4BQ07343 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE4BQ07343 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE4BQ07343 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE4BQ07343 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE4BQ07343 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE4BQ07343 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE4BQ07343 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE4BQ07343 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE4BQ07343 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE4BQ07343 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE4BQ07343 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE4BQ07343 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE4BQ07343 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE4BQ07343 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE4BQ07343 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE4BQ07343 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE4BQ07343 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE4BQ07343 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE4BQ07343 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE4BQ07343 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE4BQ07343 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE4BQ07343 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE4BQ07343 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE4BQ07343 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE4BQ07343 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE4BQ07343 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE4BQ07343 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE4BQ07343 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE4BQ07343 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE4BQ07343 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PDE4BQ07343 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PDE4BQ07343 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PDE4BQ07343 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PDE4BQ07343 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PDE4BQ07343 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE4BQ07343 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE4BQ07343 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE4BQ07343 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE4BQ07343 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE4BQ07343 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE4BQ07343 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE4BQ07343 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE4BQ07343 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE4BQ07343 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE4BQ07343 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms