Protein–RNA interactions for Protein: Q06787

FMR1, Synaptic functional regulator FMR1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMR1Q06787 EIF4G1-235ENST00000482303 493 ntTSL 218.2■□□□□ 0.58e-11■■■■□ 24.8
FMR1Q06787 CSDE1-218ENST00000610726 4312 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.147e-7■■■■□ 24.8
FMR1Q06787 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.217e-7■■■■□ 24.8
FMR1Q06787 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.47e-7■■■■□ 24.8
FMR1Q06787 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.938e-8■■■■□ 24.8
FMR1Q06787 DDB1-209ENST00000537877 1375 ntTSL 214.13□□□□□ -0.152e-7■■■■□ 24.8
FMR1Q06787 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.131e-7■■■■□ 24.8
FMR1Q06787 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.111e-7■■■■□ 24.8
FMR1Q06787 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.397e-9■■■■□ 24.8
FMR1Q06787 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.527e-9■■■■□ 24.8
FMR1Q06787 TMEM165-205ENST00000508404 1657 ntTSL 224.46■■□□□ 1.517e-9■■■■□ 24.8
FMR1Q06787 TMEM165-208ENST00000511710 731 ntTSL 39.04□□□□□ -0.967e-9■■■■□ 24.8
FMR1Q06787 TRIM28-211ENST00000597968 504 ntTSL 217.44■□□□□ 0.382e-10■■■■□ 24.8
FMR1Q06787 ANK1-207ENST00000518061 892 ntTSL 318.89■□□□□ 0.612e-6■■■■□ 24.8
FMR1Q06787 GOLGA2-211ENST00000496221 450 ntTSL 315.05■□□□□ -07e-7■■■■□ 24.8
FMR1Q06787 XRCC5-207ENST00000471649 610 ntTSL 26.86□□□□□ -1.311e-6■■■■□ 24.8
FMR1Q06787 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.536e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 ELF2-208ENST00000511006 1434 ntTSL 1 (best)29.95■■■□□ 2.386e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.016e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 WDR4-206ENST00000479429 759 ntTSL 527.43■■□□□ 1.986e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.916e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 CCDC91-219ENST00000544780 693 ntTSL 326.64■■□□□ 1.866e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 BCAR1-216ENST00000564170 552 ntTSL 426.04■■□□□ 1.764e-6■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 WDR4-204ENST00000470658 901 ntTSL 525.77■■□□□ 1.726e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.696e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 HBM-202ENST00000472539 592 ntTSL 525.58■■□□□ 1.696e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.676e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 SPATS2L-225ENST00000471533 329 ntTSL 325.16■■□□□ 1.626e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.536e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 CCDC91-218ENST00000544649 665 ntTSL 324.48■■□□□ 1.516e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.456e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 SPATS2L-216ENST00000444012 605 ntTSL 424.11■■□□□ 1.456e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 CCDC91-205ENST00000536442 1301 ntTSL 523.94■■□□□ 1.426e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 SPATS2L-221ENST00000459656 1901 ntTSL 1 (best)23.85■■□□□ 1.416e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.396e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 PPP3CC-206ENST00000522000 460 ntTSL 223.63■■□□□ 1.376e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.356e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.326e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.36e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 SPATS2L-212ENST00000428692 541 ntTSL 423.12■■□□□ 1.296e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 SPATS2L-220ENST00000457757 835 ntTSL 523.12■■□□□ 1.296e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.276e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 WDR4-207ENST00000492742 2205 ntTSL 222.9■■□□□ 1.266e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 FAM135A-216ENST00000515323 1926 ntTSL 522.72■■□□□ 1.236e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.21e-6■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 UNK-208ENST00000592629 633 ntTSL 322.42■■□□□ 1.186e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 SPATS2L-211ENST00000423749 771 ntTSL 522.35■■□□□ 1.176e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.166e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 UNK-206ENST00000589790 549 ntTSL 321.48■■□□□ 1.036e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 16e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.996e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 NUP93-221ENST00000569863 630 ntTSL 420.94■□□□□ 0.946e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.916e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.916e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.96e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 CTTN-212ENST00000527962 587 ntTSL 220.5■□□□□ 0.876e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 MYB-202ENST00000339290 3365 ntTSL 1 (best)20.43■□□□□ 0.866e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.86e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 ERVK13-1-206ENST00000568970 278 ntTSL 319.77■□□□□ 0.766e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 MYB-214ENST00000525477 3431 ntTSL 1 (best)19.67■□□□□ 0.746e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 NOP14-205ENST00000507120 703 ntTSL 319.65■□□□□ 0.746e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.736e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.726e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 UNK-202ENST00000586527 1312 ntTSL 1 (best)19.29■□□□□ 0.686e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.676e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 ANP32E-204ENST00000532744 621 ntTSL 318.97■□□□□ 0.636e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.626e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.626e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 MYB-237ENST00000533837 3492 ntTSL 1 (best)18.72■□□□□ 0.596e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.596e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.586e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.586e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 MYB-210ENST00000463282 3422 ntTSL 1 (best)18.61■□□□□ 0.576e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.542e-6■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.536e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.536e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 SPATS2L-226ENST00000471601 1730 ntTSL 218.33■□□□□ 0.526e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.526e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 MYB-204ENST00000367812 3565 ntTSL 1 (best)18.32■□□□□ 0.526e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.526e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.521e-6■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.526e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.466e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.446e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 WDR4-203ENST00000463902 609 ntTSL 317.62■□□□□ 0.416e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.416e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 SPATS2L-214ENST00000439084 584 ntTSL 317.31■□□□□ 0.366e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 DARS-203ENST00000435076 717 ntTSL 217.28■□□□□ 0.366e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.336e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.322e-6■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 ISY1-205ENST00000471497 1211 ntTSL 1 (best)17.03■□□□□ 0.326e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 WDR4-205ENST00000476326 1977 ntTSL 1 (best)16.91■□□□□ 0.36e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.276e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.266e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 DDHD1-209ENST00000557445 698 ntTSL 216.63■□□□□ 0.256e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 PTPRS-206ENST00000588552 5443 ntTSL 1 (best)16.58■□□□□ 0.246e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 UNK-204ENST00000587501 984 ntTSL 1 (best)16.56■□□□□ 0.246e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.186e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 EPB41L2-225ENST00000530707 565 ntTSL 416.15■□□□□ 0.186e-7■■■■□ 24.7
FMR1Q06787 MED26-202ENST00000597244 3871 nt16.02■□□□□ 0.161e-6■■■■□ 24.7
Retrieved 100 of 13,491 protein–RNA pairs in 68.6 ms