Protein–RNA interactions for Protein: Q05948

YLR225C, Uncharacterized SVF1-like protein YLR225C, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR225CQ05948 tL(UAG)L1tL(UAG)L1 82 nt5.4□□□□□ -1.54
YLR225CQ05948 tL(UAG)L2tL(UAG)L2 82 nt5.4□□□□□ -1.54
YLR225CQ05948 OST5YGL226C-A 261 nt5.4□□□□□ -1.54
YLR225CQ05948 PEX18YHR160C 852 nt5.4□□□□□ -1.54
YLR225CQ05948 FUN19YAL034C 1242 nt5.4□□□□□ -1.54
YLR225CQ05948 APS1YLR170C 471 nt5.4□□□□□ -1.54
YLR225CQ05948 YLR456WYLR456W 615 nt5.4□□□□□ -1.54
YLR225CQ05948 YMR099CYMR099C 894 nt5.4□□□□□ -1.54
YLR225CQ05948 YBL059WYBL059W 582 nt5.4□□□□□ -1.54
YLR225CQ05948 LEM3YNL323W 1245 nt5.4□□□□□ -1.54
YLR225CQ05948 FDH2YPL275W 711 nt5.4□□□□□ -1.54
YLR225CQ05948 SPN1YPR133C 1233 nt5.4□□□□□ -1.54
YLR225CQ05948 TSL1YML100W 3297 nt5.4□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 ERG7YHR072W 2196 nt5.4□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 WTM2YOR229W 1404 nt5.4□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 TEL2YGR099W 2067 nt5.39□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 CLB2YPR119W 1476 nt5.39□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 YBR139WYBR139W 1527 nt5.39□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 VAN1YML115C 1608 nt5.39□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 CPR4YCR069W 957 nt5.39□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 COS12YGL263W 1143 nt5.39□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 YHR173CYHR173C 339 nt5.39□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 NIT2YJL126W 924 nt5.39□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 MRPL20YKR085C 588 nt5.39□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt5.39□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 YLR347W-AYLR347W-A 141 nt5.39□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 YML047W-AYML047W-A 366 nt5.39□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 CUS2YNL286W 858 nt5.39□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 YOR314WYOR314W 330 nt5.39□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 NHP6BYBR089C-A 300 nt5.39□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 YCL007CYCL007C 393 nt5.39□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 GAT2YMR136W 1683 nt5.39□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 LAP3YNL239W 1365 nt5.39□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 THP1YOL072W 1368 nt5.39□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 FAT3YKL187C 2253 nt5.39□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 MRC1YCL061C 3291 nt5.38□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 SWI3YJL176C 2478 nt5.38□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 HSP82YPL240C 2130 nt5.38□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 CIK1YMR198W 1785 nt5.38□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 RPL13AYDL082W 600 nt5.38□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 ERD1YDR414C 1089 nt5.38□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 SVP26YHR181W 687 nt5.38□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 RFU1YLR073C 603 nt5.38□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 YOR338WYOR338W 1092 nt5.38□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 FIG1YBR040W 897 nt5.38□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 ENT1YDL161W 1365 nt5.38□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 ALD3YMR169C 1521 nt5.38□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 ALD2YMR170C 1521 nt5.38□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 URK1YNR012W 1506 nt5.38□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 YCR101CYCR101C 549 nt5.37□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 YGL138CYGL138C 1038 nt5.37□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 SCM4YGR049W 564 nt5.37□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 YGR122WYGR122W 1209 nt5.37□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 YIR023C-AYIR023C-A 324 nt5.37□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 PRP21YJL203W 843 nt5.37□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 IOC4YMR044W 1428 nt5.37□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 MRS2YOR334W 1413 nt5.37□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 SOF1YLL011W 1470 nt5.37□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 CRZ1YNL027W 2037 nt5.36□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 KEX2YNL238W 2445 nt5.36□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 YGL214WYGL214W 486 nt5.36□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 GLG2YJL137C 1143 nt5.36□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 MMM1YLL006W 1281 nt5.36□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 YLR379WYLR379W 375 nt5.36□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 FMP41YNL168C 780 nt5.36□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 SNF8YPL002C 702 nt5.36□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 CWC27YPL064C 906 nt5.36□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 HRR25YPL204W 1485 nt5.36□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 ESF1YDR365C 1887 nt5.36□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 SSA2YLL024C 1920 nt5.36□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 PUF2YPR042C 3228 nt5.35□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 GZF3YJL110C 1656 nt5.35□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 REF2YDR195W 1602 nt5.35□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 ADE4YMR300C 1533 nt5.35□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 YNL011CYNL011C 1335 nt5.35□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 ATC1YDR184C 885 nt5.35□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 CDC43YGL155W 1131 nt5.35□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 YIL163CYIL163C 354 nt5.35□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 ELO3YLR372W 1038 nt5.35□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 WRS1YOL097C 1299 nt5.35□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt5.35□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 TRS33YOR115C 807 nt5.35□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 HUT1YPL244C 1020 nt5.35□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 YPR177CYPR177C 372 nt5.35□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 PRM7YDL039C 2097 nt5.35□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 MIH1YMR036C 1665 nt5.34□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 FRT2YAL028W 1587 nt5.34□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 VPS38YLR360W 1320 nt5.34□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 GRX3YDR098C 858 nt5.34□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 RUB1YDR139C 234 nt5.34□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 TLG1YDR468C 675 nt5.34□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 PPX1YHR201C 1194 nt5.34□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 PFA3YNL326C 1011 nt5.34□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 TRM10YOL093W 882 nt5.34□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 MRP51YPL118W 1035 nt5.34□□□□□ -1.55
YLR225CQ05948 RKM3YBR030W 1659 nt5.34□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 BUD7YOR299W 2241 nt5.33□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 ASF2YDL197C 1578 nt5.33□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 RCM1YNL022C 1473 nt5.33□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 NUS1YDL193W 1128 nt5.33□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17 ms