Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNTN2Q02246 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNTN2Q02246 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNTN2Q02246 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNTN2Q02246 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNTN2Q02246 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNTN2Q02246 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNTN2Q02246 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNTN2Q02246 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNTN2Q02246 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNTN2Q02246 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CNTN2Q02246 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNTN2Q02246 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNTN2Q02246 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNTN2Q02246 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNTN2Q02246 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNTN2Q02246 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CNTN2Q02246 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTN2Q02246 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTN2Q02246 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTN2Q02246 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTN2Q02246 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTN2Q02246 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTN2Q02246 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTN2Q02246 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTN2Q02246 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTN2Q02246 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTN2Q02246 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTN2Q02246 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTN2Q02246 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTN2Q02246 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTN2Q02246 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTN2Q02246 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTN2Q02246 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTN2Q02246 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTN2Q02246 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTN2Q02246 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTN2Q02246 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTN2Q02246 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTN2Q02246 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTN2Q02246 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTN2Q02246 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTN2Q02246 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTN2Q02246 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTN2Q02246 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTN2Q02246 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTN2Q02246 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTN2Q02246 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTN2Q02246 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTN2Q02246 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTN2Q02246 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTN2Q02246 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTN2Q02246 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTN2Q02246 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTN2Q02246 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTN2Q02246 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTN2Q02246 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNTN2Q02246 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNTN2Q02246 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNTN2Q02246 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNTN2Q02246 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNTN2Q02246 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNTN2Q02246 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNTN2Q02246 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNTN2Q02246 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTN2Q02246 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTN2Q02246 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTN2Q02246 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTN2Q02246 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTN2Q02246 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTN2Q02246 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTN2Q02246 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTN2Q02246 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNTN2Q02246 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNTN2Q02246 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNTN2Q02246 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNTN2Q02246 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNTN2Q02246 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CNTN2Q02246 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNTN2Q02246 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CNTN2Q02246 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNTN2Q02246 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNTN2Q02246 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNTN2Q02246 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CNTN2Q02246 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNTN2Q02246 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CNTN2Q02246 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CNTN2Q02246 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CNTN2Q02246 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CNTN2Q02246 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CNTN2Q02246 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNTN2Q02246 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNTN2Q02246 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNTN2Q02246 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNTN2Q02246 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNTN2Q02246 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNTN2Q02246 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNTN2Q02246 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNTN2Q02246 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNTN2Q02246 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms