Protein–RNA interactions for Protein: Q00973

B4GALNT1, Beta-1,4 N-acetylgalactosaminyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4GALNT1Q00973 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
B4GALNT1Q00973 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
B4GALNT1Q00973 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
B4GALNT1Q00973 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
B4GALNT1Q00973 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
B4GALNT1Q00973 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
B4GALNT1Q00973 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
B4GALNT1Q00973 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
B4GALNT1Q00973 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
B4GALNT1Q00973 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
B4GALNT1Q00973 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
B4GALNT1Q00973 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
B4GALNT1Q00973 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
B4GALNT1Q00973 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
B4GALNT1Q00973 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
B4GALNT1Q00973 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
B4GALNT1Q00973 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
B4GALNT1Q00973 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
B4GALNT1Q00973 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
B4GALNT1Q00973 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
B4GALNT1Q00973 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
B4GALNT1Q00973 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
B4GALNT1Q00973 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
B4GALNT1Q00973 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
B4GALNT1Q00973 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
B4GALNT1Q00973 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
B4GALNT1Q00973 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
B4GALNT1Q00973 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
B4GALNT1Q00973 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
B4GALNT1Q00973 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
B4GALNT1Q00973 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
B4GALNT1Q00973 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
B4GALNT1Q00973 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
B4GALNT1Q00973 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
B4GALNT1Q00973 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
B4GALNT1Q00973 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
B4GALNT1Q00973 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
B4GALNT1Q00973 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
B4GALNT1Q00973 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
B4GALNT1Q00973 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
B4GALNT1Q00973 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
B4GALNT1Q00973 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
B4GALNT1Q00973 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
B4GALNT1Q00973 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
B4GALNT1Q00973 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
B4GALNT1Q00973 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
B4GALNT1Q00973 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
B4GALNT1Q00973 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
B4GALNT1Q00973 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
B4GALNT1Q00973 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
B4GALNT1Q00973 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
B4GALNT1Q00973 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
B4GALNT1Q00973 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
B4GALNT1Q00973 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
B4GALNT1Q00973 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
B4GALNT1Q00973 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
B4GALNT1Q00973 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
B4GALNT1Q00973 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
B4GALNT1Q00973 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
B4GALNT1Q00973 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
B4GALNT1Q00973 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
B4GALNT1Q00973 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
B4GALNT1Q00973 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
B4GALNT1Q00973 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
B4GALNT1Q00973 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
B4GALNT1Q00973 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
B4GALNT1Q00973 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
B4GALNT1Q00973 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
B4GALNT1Q00973 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
B4GALNT1Q00973 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
B4GALNT1Q00973 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
B4GALNT1Q00973 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
B4GALNT1Q00973 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
B4GALNT1Q00973 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
B4GALNT1Q00973 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
B4GALNT1Q00973 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
B4GALNT1Q00973 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
B4GALNT1Q00973 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
B4GALNT1Q00973 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
B4GALNT1Q00973 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
B4GALNT1Q00973 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
B4GALNT1Q00973 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
B4GALNT1Q00973 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
B4GALNT1Q00973 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
B4GALNT1Q00973 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
B4GALNT1Q00973 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
B4GALNT1Q00973 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
B4GALNT1Q00973 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
B4GALNT1Q00973 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
B4GALNT1Q00973 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
B4GALNT1Q00973 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
B4GALNT1Q00973 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
B4GALNT1Q00973 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
B4GALNT1Q00973 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
B4GALNT1Q00973 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
B4GALNT1Q00973 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
B4GALNT1Q00973 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
B4GALNT1Q00973 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
B4GALNT1Q00973 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
B4GALNT1Q00973 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms