Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms