Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
HDLBPQ00341 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HDLBPQ00341 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
HDLBPQ00341 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
HDLBPQ00341 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HDLBPQ00341 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HDLBPQ00341 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HDLBPQ00341 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HDLBPQ00341 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HDLBPQ00341 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HDLBPQ00341 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HDLBPQ00341 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HDLBPQ00341 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HDLBPQ00341 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
HDLBPQ00341 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HDLBPQ00341 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HDLBPQ00341 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HDLBPQ00341 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HDLBPQ00341 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HDLBPQ00341 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HDLBPQ00341 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HDLBPQ00341 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HDLBPQ00341 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HDLBPQ00341 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HDLBPQ00341 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HDLBPQ00341 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HDLBPQ00341 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HDLBPQ00341 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HDLBPQ00341 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HDLBPQ00341 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HDLBPQ00341 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HDLBPQ00341 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
HDLBPQ00341 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HDLBPQ00341 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HDLBPQ00341 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HDLBPQ00341 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HDLBPQ00341 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HDLBPQ00341 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HDLBPQ00341 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HDLBPQ00341 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HDLBPQ00341 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HDLBPQ00341 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HDLBPQ00341 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HDLBPQ00341 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HDLBPQ00341 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HDLBPQ00341 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HDLBPQ00341 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HDLBPQ00341 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HDLBPQ00341 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HDLBPQ00341 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HDLBPQ00341 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
HDLBPQ00341 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HDLBPQ00341 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HDLBPQ00341 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HDLBPQ00341 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HDLBPQ00341 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HDLBPQ00341 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
HDLBPQ00341 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HDLBPQ00341 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HDLBPQ00341 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HDLBPQ00341 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HDLBPQ00341 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HDLBPQ00341 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HDLBPQ00341 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HDLBPQ00341 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HDLBPQ00341 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
HDLBPQ00341 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HDLBPQ00341 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HDLBPQ00341 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HDLBPQ00341 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HDLBPQ00341 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HDLBPQ00341 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
HDLBPQ00341 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HDLBPQ00341 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HDLBPQ00341 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HDLBPQ00341 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HDLBPQ00341 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HDLBPQ00341 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HDLBPQ00341 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HDLBPQ00341 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HDLBPQ00341 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HDLBPQ00341 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HDLBPQ00341 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HDLBPQ00341 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HDLBPQ00341 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HDLBPQ00341 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HDLBPQ00341 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HDLBPQ00341 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HDLBPQ00341 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HDLBPQ00341 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HDLBPQ00341 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HDLBPQ00341 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HDLBPQ00341 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HDLBPQ00341 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HDLBPQ00341 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HDLBPQ00341 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HDLBPQ00341 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HDLBPQ00341 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
HDLBPQ00341 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HDLBPQ00341 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms