Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CRB1P82279 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CRB1P82279 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CRB1P82279 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CRB1P82279 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CRB1P82279 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CRB1P82279 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CRB1P82279 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CRB1P82279 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CRB1P82279 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CRB1P82279 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CRB1P82279 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CRB1P82279 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CRB1P82279 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CRB1P82279 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CRB1P82279 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CRB1P82279 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CRB1P82279 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CRB1P82279 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CRB1P82279 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CRB1P82279 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CRB1P82279 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CRB1P82279 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CRB1P82279 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CRB1P82279 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CRB1P82279 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CRB1P82279 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CRB1P82279 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CRB1P82279 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CRB1P82279 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CRB1P82279 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CRB1P82279 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CRB1P82279 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CRB1P82279 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CRB1P82279 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CRB1P82279 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CRB1P82279 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CRB1P82279 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CRB1P82279 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CRB1P82279 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CRB1P82279 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CRB1P82279 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CRB1P82279 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CRB1P82279 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CRB1P82279 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CRB1P82279 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CRB1P82279 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CRB1P82279 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CRB1P82279 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CRB1P82279 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CRB1P82279 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CRB1P82279 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CRB1P82279 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CRB1P82279 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CRB1P82279 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CRB1P82279 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CRB1P82279 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CRB1P82279 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CRB1P82279 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CRB1P82279 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CRB1P82279 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CRB1P82279 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CRB1P82279 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CRB1P82279 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CRB1P82279 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
CRB1P82279 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CRB1P82279 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CRB1P82279 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CRB1P82279 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CRB1P82279 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CRB1P82279 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CRB1P82279 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CRB1P82279 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CRB1P82279 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CRB1P82279 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CRB1P82279 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CRB1P82279 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CRB1P82279 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CRB1P82279 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CRB1P82279 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CRB1P82279 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CRB1P82279 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CRB1P82279 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CRB1P82279 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CRB1P82279 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CRB1P82279 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CRB1P82279 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CRB1P82279 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CRB1P82279 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CRB1P82279 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CRB1P82279 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CRB1P82279 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CRB1P82279 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CRB1P82279 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CRB1P82279 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CRB1P82279 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CRB1P82279 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CRB1P82279 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CRB1P82279 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CRB1P82279 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms