Protein–RNA interactions for Protein: P78385

KRT83, Keratin, type II cuticular Hb3, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT83P78385 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT83P78385 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT83P78385 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT83P78385 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT83P78385 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT83P78385 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT83P78385 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT83P78385 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT83P78385 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT83P78385 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT83P78385 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT83P78385 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT83P78385 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT83P78385 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT83P78385 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT83P78385 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
KRT83P78385 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT83P78385 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT83P78385 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT83P78385 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT83P78385 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT83P78385 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT83P78385 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT83P78385 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT83P78385 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT83P78385 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT83P78385 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT83P78385 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT83P78385 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT83P78385 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT83P78385 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT83P78385 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT83P78385 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT83P78385 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT83P78385 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT83P78385 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT83P78385 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT83P78385 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT83P78385 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT83P78385 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT83P78385 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT83P78385 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT83P78385 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT83P78385 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT83P78385 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT83P78385 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT83P78385 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT83P78385 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT83P78385 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT83P78385 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT83P78385 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT83P78385 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT83P78385 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT83P78385 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT83P78385 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT83P78385 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT83P78385 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT83P78385 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT83P78385 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT83P78385 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT83P78385 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT83P78385 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT83P78385 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT83P78385 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT83P78385 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT83P78385 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT83P78385 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT83P78385 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT83P78385 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT83P78385 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT83P78385 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT83P78385 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT83P78385 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT83P78385 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT83P78385 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT83P78385 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT83P78385 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT83P78385 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT83P78385 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT83P78385 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT83P78385 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT83P78385 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT83P78385 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT83P78385 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT83P78385 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT83P78385 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT83P78385 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT83P78385 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT83P78385 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT83P78385 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT83P78385 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT83P78385 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT83P78385 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT83P78385 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT83P78385 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT83P78385 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT83P78385 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT83P78385 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT83P78385 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT83P78385 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms