Protein–RNA interactions for Protein: P63027

VAMP2, Vesicle-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP2P63027 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAMP2P63027 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms