Protein–RNA interactions for Protein: P62891

RPL39, 60S ribosomal protein L39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P62891 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL39P62891 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL39P62891 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL39P62891 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL39P62891 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL39P62891 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL39P62891 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL39P62891 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL39P62891 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL39P62891 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL39P62891 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL39P62891 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL39P62891 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL39P62891 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL39P62891 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL39P62891 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL39P62891 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL39P62891 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL39P62891 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL39P62891 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL39P62891 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL39P62891 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL39P62891 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL39P62891 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL39P62891 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL39P62891 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL39P62891 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL39P62891 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL39P62891 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL39P62891 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL39P62891 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL39P62891 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL39P62891 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL39P62891 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL39P62891 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL39P62891 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL39P62891 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL39P62891 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL39P62891 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL39P62891 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL39P62891 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL39P62891 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL39P62891 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL39P62891 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL39P62891 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL39P62891 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL39P62891 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL39P62891 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL39P62891 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL39P62891 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL39P62891 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL39P62891 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL39P62891 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL39P62891 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL39P62891 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL39P62891 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL39P62891 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL39P62891 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL39P62891 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL39P62891 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL39P62891 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL39P62891 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL39P62891 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL39P62891 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL39P62891 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL39P62891 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL39P62891 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL39P62891 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL39P62891 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL39P62891 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL39P62891 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL39P62891 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL39P62891 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL39P62891 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL39P62891 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL39P62891 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL39P62891 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL39P62891 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL39P62891 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL39P62891 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL39P62891 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL39P62891 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL39P62891 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL39P62891 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL39P62891 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL39P62891 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL39P62891 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL39P62891 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL39P62891 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL39P62891 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPL39P62891 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
RPL39P62891 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPL39P62891 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPL39P62891 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPL39P62891 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPL39P62891 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL39P62891 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL39P62891 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL39P62891 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL39P62891 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms