Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVS71-1P61550 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms