Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms