Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM3BP58499 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM3BP58499 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM3BP58499 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM3BP58499 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM3BP58499 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM3BP58499 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM3BP58499 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM3BP58499 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM3BP58499 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM3BP58499 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM3BP58499 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM3BP58499 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM3BP58499 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM3BP58499 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM3BP58499 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM3BP58499 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM3BP58499 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM3BP58499 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms