Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RIPK4P57078 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RIPK4P57078 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RIPK4P57078 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RIPK4P57078 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RIPK4P57078 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RIPK4P57078 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RIPK4P57078 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
RIPK4P57078 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RIPK4P57078 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RIPK4P57078 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RIPK4P57078 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RIPK4P57078 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RIPK4P57078 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RIPK4P57078 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RIPK4P57078 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RIPK4P57078 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RIPK4P57078 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RIPK4P57078 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RIPK4P57078 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RIPK4P57078 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RIPK4P57078 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RIPK4P57078 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RIPK4P57078 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RIPK4P57078 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RIPK4P57078 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RIPK4P57078 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RIPK4P57078 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RIPK4P57078 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RIPK4P57078 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RIPK4P57078 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RIPK4P57078 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RIPK4P57078 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RIPK4P57078 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RIPK4P57078 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RIPK4P57078 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RIPK4P57078 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RIPK4P57078 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RIPK4P57078 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RIPK4P57078 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RIPK4P57078 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RIPK4P57078 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RIPK4P57078 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RIPK4P57078 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RIPK4P57078 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RIPK4P57078 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RIPK4P57078 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RIPK4P57078 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
RIPK4P57078 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RIPK4P57078 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RIPK4P57078 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RIPK4P57078 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RIPK4P57078 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RIPK4P57078 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RIPK4P57078 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RIPK4P57078 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RIPK4P57078 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RIPK4P57078 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
RIPK4P57078 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
RIPK4P57078 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RIPK4P57078 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RIPK4P57078 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RIPK4P57078 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RIPK4P57078 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RIPK4P57078 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RIPK4P57078 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RIPK4P57078 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RIPK4P57078 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RIPK4P57078 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RIPK4P57078 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RIPK4P57078 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RIPK4P57078 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RIPK4P57078 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RIPK4P57078 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RIPK4P57078 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RIPK4P57078 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RIPK4P57078 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RIPK4P57078 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RIPK4P57078 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RIPK4P57078 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RIPK4P57078 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RIPK4P57078 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RIPK4P57078 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RIPK4P57078 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RIPK4P57078 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RIPK4P57078 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RIPK4P57078 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RIPK4P57078 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RIPK4P57078 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RIPK4P57078 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
RIPK4P57078 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RIPK4P57078 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RIPK4P57078 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RIPK4P57078 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RIPK4P57078 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RIPK4P57078 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RIPK4P57078 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RIPK4P57078 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RIPK4P57078 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RIPK4P57078 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms