Protein–RNA interactions for Protein: P56589

PEX3, Peroxisomal biogenesis factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX3P56589 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PEX3P56589 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PEX3P56589 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PEX3P56589 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PEX3P56589 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PEX3P56589 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PEX3P56589 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PEX3P56589 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PEX3P56589 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PEX3P56589 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PEX3P56589 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PEX3P56589 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PEX3P56589 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PEX3P56589 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PEX3P56589 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PEX3P56589 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PEX3P56589 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PEX3P56589 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PEX3P56589 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PEX3P56589 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PEX3P56589 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PEX3P56589 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PEX3P56589 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PEX3P56589 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PEX3P56589 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PEX3P56589 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PEX3P56589 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PEX3P56589 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PEX3P56589 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PEX3P56589 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PEX3P56589 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PEX3P56589 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PEX3P56589 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PEX3P56589 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PEX3P56589 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PEX3P56589 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PEX3P56589 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PEX3P56589 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PEX3P56589 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PEX3P56589 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PEX3P56589 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PEX3P56589 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PEX3P56589 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PEX3P56589 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PEX3P56589 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PEX3P56589 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PEX3P56589 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PEX3P56589 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PEX3P56589 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PEX3P56589 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PEX3P56589 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PEX3P56589 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PEX3P56589 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PEX3P56589 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PEX3P56589 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PEX3P56589 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PEX3P56589 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PEX3P56589 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PEX3P56589 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PEX3P56589 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PEX3P56589 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PEX3P56589 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PEX3P56589 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PEX3P56589 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PEX3P56589 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PEX3P56589 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PEX3P56589 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PEX3P56589 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PEX3P56589 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PEX3P56589 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PEX3P56589 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PEX3P56589 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PEX3P56589 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PEX3P56589 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PEX3P56589 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PEX3P56589 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PEX3P56589 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PEX3P56589 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PEX3P56589 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PEX3P56589 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PEX3P56589 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PEX3P56589 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PEX3P56589 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PEX3P56589 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PEX3P56589 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PEX3P56589 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PEX3P56589 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PEX3P56589 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PEX3P56589 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PEX3P56589 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PEX3P56589 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PEX3P56589 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PEX3P56589 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PEX3P56589 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PEX3P56589 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PEX3P56589 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PEX3P56589 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PEX3P56589 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PEX3P56589 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PEX3P56589 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms