Protein–RNA interactions for Protein: P55899

FCGRT, IgG receptor FcRn large subunit p51, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCGRTP55899 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
FCGRTP55899 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FCGRTP55899 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FCGRTP55899 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FCGRTP55899 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FCGRTP55899 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FCGRTP55899 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FCGRTP55899 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FCGRTP55899 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FCGRTP55899 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
FCGRTP55899 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FCGRTP55899 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
FCGRTP55899 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FCGRTP55899 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FCGRTP55899 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FCGRTP55899 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FCGRTP55899 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FCGRTP55899 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FCGRTP55899 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FCGRTP55899 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FCGRTP55899 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
FCGRTP55899 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FCGRTP55899 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FCGRTP55899 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FCGRTP55899 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FCGRTP55899 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FCGRTP55899 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FCGRTP55899 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FCGRTP55899 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FCGRTP55899 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FCGRTP55899 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FCGRTP55899 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FCGRTP55899 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FCGRTP55899 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FCGRTP55899 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FCGRTP55899 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FCGRTP55899 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FCGRTP55899 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FCGRTP55899 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FCGRTP55899 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FCGRTP55899 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FCGRTP55899 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FCGRTP55899 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
FCGRTP55899 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FCGRTP55899 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
FCGRTP55899 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FCGRTP55899 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FCGRTP55899 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FCGRTP55899 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FCGRTP55899 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FCGRTP55899 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FCGRTP55899 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FCGRTP55899 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FCGRTP55899 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FCGRTP55899 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FCGRTP55899 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FCGRTP55899 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
FCGRTP55899 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FCGRTP55899 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FCGRTP55899 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FCGRTP55899 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FCGRTP55899 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FCGRTP55899 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FCGRTP55899 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FCGRTP55899 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FCGRTP55899 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FCGRTP55899 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FCGRTP55899 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FCGRTP55899 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FCGRTP55899 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FCGRTP55899 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FCGRTP55899 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FCGRTP55899 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FCGRTP55899 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FCGRTP55899 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
FCGRTP55899 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FCGRTP55899 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
FCGRTP55899 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FCGRTP55899 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
FCGRTP55899 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FCGRTP55899 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FCGRTP55899 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FCGRTP55899 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FCGRTP55899 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FCGRTP55899 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FCGRTP55899 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
FCGRTP55899 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
FCGRTP55899 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FCGRTP55899 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FCGRTP55899 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FCGRTP55899 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FCGRTP55899 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FCGRTP55899 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FCGRTP55899 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FCGRTP55899 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FCGRTP55899 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FCGRTP55899 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FCGRTP55899 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FCGRTP55899 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FCGRTP55899 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms