Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CASP7P55210 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CASP7P55210 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CASP7P55210 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CASP7P55210 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CASP7P55210 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CASP7P55210 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CASP7P55210 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CASP7P55210 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CASP7P55210 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CASP7P55210 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CASP7P55210 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CASP7P55210 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CASP7P55210 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CASP7P55210 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CASP7P55210 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CASP7P55210 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CASP7P55210 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CASP7P55210 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CASP7P55210 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CASP7P55210 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CASP7P55210 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CASP7P55210 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CASP7P55210 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CASP7P55210 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CASP7P55210 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CASP7P55210 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CASP7P55210 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CASP7P55210 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CASP7P55210 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CASP7P55210 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CASP7P55210 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CASP7P55210 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CASP7P55210 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CASP7P55210 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CASP7P55210 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CASP7P55210 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CASP7P55210 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CASP7P55210 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CASP7P55210 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CASP7P55210 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CASP7P55210 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CASP7P55210 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CASP7P55210 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CASP7P55210 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CASP7P55210 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CASP7P55210 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CASP7P55210 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CASP7P55210 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CASP7P55210 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CASP7P55210 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CASP7P55210 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CASP7P55210 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CASP7P55210 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CASP7P55210 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CASP7P55210 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CASP7P55210 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CASP7P55210 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CASP7P55210 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CASP7P55210 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CASP7P55210 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CASP7P55210 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CASP7P55210 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CASP7P55210 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CASP7P55210 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CASP7P55210 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CASP7P55210 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CASP7P55210 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CASP7P55210 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CASP7P55210 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CASP7P55210 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CASP7P55210 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CASP7P55210 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CASP7P55210 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CASP7P55210 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CASP7P55210 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CASP7P55210 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CASP7P55210 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CASP7P55210 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CASP7P55210 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CASP7P55210 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CASP7P55210 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CASP7P55210 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CASP7P55210 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CASP7P55210 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CASP7P55210 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CASP7P55210 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CASP7P55210 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CASP7P55210 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CASP7P55210 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CASP7P55210 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CASP7P55210 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CASP7P55210 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CASP7P55210 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CASP7P55210 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CASP7P55210 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CASP7P55210 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CASP7P55210 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CASP7P55210 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CASP7P55210 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms