Protein–RNA interactions for Protein: P55040

GEM, GTP-binding protein GEM, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMP55040 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GEMP55040 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GEMP55040 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GEMP55040 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GEMP55040 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GEMP55040 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GEMP55040 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GEMP55040 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GEMP55040 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GEMP55040 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GEMP55040 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GEMP55040 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GEMP55040 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GEMP55040 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GEMP55040 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GEMP55040 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GEMP55040 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GEMP55040 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GEMP55040 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GEMP55040 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GEMP55040 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GEMP55040 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GEMP55040 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GEMP55040 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
GEMP55040 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GEMP55040 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GEMP55040 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GEMP55040 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GEMP55040 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GEMP55040 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GEMP55040 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GEMP55040 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GEMP55040 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GEMP55040 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GEMP55040 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GEMP55040 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GEMP55040 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GEMP55040 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GEMP55040 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GEMP55040 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GEMP55040 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GEMP55040 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GEMP55040 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GEMP55040 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GEMP55040 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GEMP55040 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GEMP55040 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GEMP55040 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GEMP55040 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GEMP55040 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GEMP55040 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GEMP55040 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GEMP55040 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GEMP55040 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GEMP55040 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GEMP55040 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GEMP55040 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GEMP55040 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GEMP55040 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GEMP55040 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GEMP55040 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GEMP55040 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GEMP55040 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GEMP55040 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GEMP55040 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GEMP55040 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GEMP55040 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GEMP55040 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GEMP55040 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GEMP55040 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GEMP55040 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GEMP55040 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GEMP55040 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GEMP55040 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GEMP55040 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GEMP55040 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GEMP55040 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GEMP55040 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GEMP55040 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GEMP55040 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GEMP55040 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GEMP55040 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GEMP55040 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GEMP55040 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GEMP55040 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GEMP55040 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GEMP55040 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GEMP55040 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GEMP55040 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GEMP55040 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GEMP55040 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GEMP55040 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GEMP55040 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GEMP55040 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GEMP55040 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GEMP55040 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GEMP55040 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GEMP55040 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GEMP55040 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GEMP55040 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms