Protein–RNA interactions for Protein: P54845

NRL, Neural retina-specific leucine zipper protein, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRLP54845 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NRLP54845 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NRLP54845 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NRLP54845 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NRLP54845 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NRLP54845 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NRLP54845 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NRLP54845 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NRLP54845 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NRLP54845 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NRLP54845 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NRLP54845 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NRLP54845 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NRLP54845 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NRLP54845 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NRLP54845 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NRLP54845 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NRLP54845 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NRLP54845 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NRLP54845 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NRLP54845 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NRLP54845 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NRLP54845 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NRLP54845 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NRLP54845 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NRLP54845 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NRLP54845 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NRLP54845 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NRLP54845 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NRLP54845 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NRLP54845 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NRLP54845 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NRLP54845 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NRLP54845 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NRLP54845 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NRLP54845 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NRLP54845 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NRLP54845 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NRLP54845 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NRLP54845 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NRLP54845 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NRLP54845 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NRLP54845 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NRLP54845 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NRLP54845 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NRLP54845 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NRLP54845 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NRLP54845 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NRLP54845 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NRLP54845 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NRLP54845 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NRLP54845 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NRLP54845 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NRLP54845 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NRLP54845 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NRLP54845 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NRLP54845 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NRLP54845 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NRLP54845 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NRLP54845 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NRLP54845 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NRLP54845 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NRLP54845 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NRLP54845 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NRLP54845 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NRLP54845 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NRLP54845 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NRLP54845 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NRLP54845 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NRLP54845 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NRLP54845 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NRLP54845 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NRLP54845 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NRLP54845 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NRLP54845 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NRLP54845 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NRLP54845 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NRLP54845 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NRLP54845 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NRLP54845 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NRLP54845 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NRLP54845 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NRLP54845 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NRLP54845 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NRLP54845 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NRLP54845 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NRLP54845 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NRLP54845 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NRLP54845 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NRLP54845 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NRLP54845 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NRLP54845 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NRLP54845 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NRLP54845 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NRLP54845 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NRLP54845 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NRLP54845 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NRLP54845 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NRLP54845 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NRLP54845 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms