Protein–RNA interactions for Protein: P54252

ATXN3, Ataxin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3P54252 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN3P54252 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms