Protein–RNA interactions for Protein: P54136

RARS, Arginine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARSP54136 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RARSP54136 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RARSP54136 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RARSP54136 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RARSP54136 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RARSP54136 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RARSP54136 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RARSP54136 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RARSP54136 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RARSP54136 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RARSP54136 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RARSP54136 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RARSP54136 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RARSP54136 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RARSP54136 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RARSP54136 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RARSP54136 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RARSP54136 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RARSP54136 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RARSP54136 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RARSP54136 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
RARSP54136 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RARSP54136 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RARSP54136 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
RARSP54136 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RARSP54136 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RARSP54136 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RARSP54136 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RARSP54136 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RARSP54136 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RARSP54136 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
RARSP54136 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RARSP54136 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RARSP54136 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RARSP54136 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RARSP54136 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RARSP54136 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RARSP54136 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
RARSP54136 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RARSP54136 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RARSP54136 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RARSP54136 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RARSP54136 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
RARSP54136 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RARSP54136 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RARSP54136 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RARSP54136 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RARSP54136 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RARSP54136 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RARSP54136 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RARSP54136 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RARSP54136 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RARSP54136 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RARSP54136 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RARSP54136 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RARSP54136 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RARSP54136 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RARSP54136 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RARSP54136 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RARSP54136 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RARSP54136 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
RARSP54136 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RARSP54136 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RARSP54136 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RARSP54136 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RARSP54136 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
RARSP54136 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
RARSP54136 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
RARSP54136 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RARSP54136 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RARSP54136 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RARSP54136 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RARSP54136 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RARSP54136 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RARSP54136 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RARSP54136 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RARSP54136 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
RARSP54136 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RARSP54136 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RARSP54136 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RARSP54136 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RARSP54136 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RARSP54136 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RARSP54136 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RARSP54136 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RARSP54136 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RARSP54136 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
RARSP54136 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RARSP54136 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RARSP54136 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RARSP54136 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RARSP54136 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RARSP54136 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RARSP54136 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RARSP54136 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RARSP54136 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RARSP54136 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RARSP54136 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RARSP54136 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RARSP54136 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms