Protein–RNA interactions for Protein: P53847

DSL1, Protein transport protein DSL1, yeast

Predictions only

Length 754 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSL1	P53847	YIF1	YNL263C	945 nt		4.18	□□□□□ -1.74
DSL1	P53847	MED7	YOL135C	669 nt		4.18	□□□□□ -1.74
DSL1	P53847	snR37	snR37	386 nt		4.18	□□□□□ -1.74
DSL1	P53847	RTC1	YOL138C	4026 nt		4.18	□□□□□ -1.74
DSL1	P53847	CLB5	YPR120C	1308 nt		4.18	□□□□□ -1.74
DSL1	P53847	SSH1	YBR283C	1473 nt		4.18	□□□□□ -1.74
DSL1	P53847	IPI3	YNL182C	1668 nt		4.17	□□□□□ -1.74
DSL1	P53847	DAS2	YDR020C	699 nt		4.17	□□□□□ -1.74
DSL1	P53847	POP6	YGR030C	477 nt		4.17	□□□□□ -1.74
DSL1	P53847	RAD10	YML095C	633 nt		4.17	□□□□□ -1.74
DSL1	P53847	SHE1	YBL031W	1017 nt		4.17	□□□□□ -1.74
DSL1	P53847	VPS21	YOR089C	633 nt		4.17	□□□□□ -1.74
DSL1	P53847	CDC9	YDL164C	2268 nt		4.17	□□□□□ -1.74
DSL1	P53847	FAR10	YLR238W	1437 nt		4.17	□□□□□ -1.74
DSL1	P53847	NGL3	YML118W	1518 nt		4.16	□□□□□ -1.74
DSL1	P53847	TAF6	YGL112C	1551 nt		4.16	□□□□□ -1.74
DSL1	P53847	IDS2	YJL146W	1410 nt		4.16	□□□□□ -1.74
DSL1	P53847	DHR2	YKL078W	2208 nt		4.16	□□□□□ -1.74
DSL1	P53847	THI13	YDL244W	1023 nt		4.16	□□□□□ -1.74
DSL1	P53847	LOH1	YJL038C	660 nt		4.16	□□□□□ -1.74
DSL1	P53847	THI11	YJR156C	1023 nt		4.16	□□□□□ -1.74
DSL1	P53847	NMA1	YLR328W	1206 nt		4.16	□□□□□ -1.74
DSL1	P53847	FEX1	YOR390W	1128 nt		4.16	□□□□□ -1.74
DSL1	P53847	FEX2	YPL279C	1128 nt		4.16	□□□□□ -1.74
DSL1	P53847	PBN1	YCL052C	1251 nt		4.16	□□□□□ -1.74
DSL1	P53847	POL12	YBL035C	2118 nt		4.16	□□□□□ -1.74
DSL1	P53847	BIK1	YCL029C	1323 nt		4.16	□□□□□ -1.74
DSL1	P53847	STV1	YMR054W	2673 nt		4.16	□□□□□ -1.74
DSL1	P53847	NPL4	YBR170C	1743 nt		4.15	□□□□□ -1.74
DSL1	P53847	HPR1	YDR138W	2259 nt		4.15	□□□□□ -1.74
DSL1	P53847	FMP25	YLR077W	1752 nt		4.15	□□□□□ -1.74
DSL1	P53847	ALG11	YNL048W	1647 nt		4.15	□□□□□ -1.74
DSL1	P53847	ADH4	YGL256W	1149 nt		4.15	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	PAM18	YLR008C	507 nt		4.15	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	YPR059C	YPR059C	387 nt		4.15	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	YBR103C-A	YBR103C-A	144 nt		4.15	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	IOC2	YLR095C	2439 nt		4.15	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	MMT1	YMR177W	1533 nt		4.15	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	YTM1	YOR272W	1383 nt		4.14	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	MAF1	YDR005C	1188 nt		4.14	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	RPL24A	YGL031C	468 nt		4.14	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	SOL4	YGR248W	768 nt		4.14	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	YIL171W	YIL171W	330 nt		4.14	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	RPS1B	YML063W	768 nt		4.14	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	ERD2	YBL040C	660 nt		4.14	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	SIW14	YNL032W	846 nt		4.14	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	CIN5	YOR028C	888 nt		4.14	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	MRPL37	YBR268W	318 nt		4.14	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	TPA1	YER049W	1935 nt		4.14	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	PRM1	YNL279W	1986 nt		4.14	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	EMP47	YFL048C	1338 nt		4.14	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	CHD1	YER164W	4407 nt		4.13	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	ABP140	YOR239W	1887 nt		4.13	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	EMC1	YCL045C	2283 nt		4.13	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	YIL001W	YIL001W	1542 nt		4.13	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	NOP58	YOR310C	1536 nt		4.13	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	snR78	snR78	87 nt		4.13	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	YDR336W	YDR336W	945 nt		4.13	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	YHR069C-A	YHR069C-A	363 nt		4.13	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	YBL059W	YBL059W	582 nt		4.13	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	AIM39	YOL053W	1188 nt		4.13	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	RPS19A	YOL121C	435 nt		4.13	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	SUL2	YLR092W	2682 nt		4.13	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	MSN4	YKL062W	1893 nt		4.13	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	CLN2	YPL256C	1638 nt		4.13	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	ENT1	YDL161W	1365 nt		4.13	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	SPT16	YGL207W	3108 nt		4.12	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	SOF1	YLL011W	1470 nt		4.12	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	MSS2	YDL107W	1056 nt		4.12	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	GEP4	YHR100C	558 nt		4.12	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	YJR112W-A	YJR112W-A	330 nt		4.12	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	DID4	YKL002W	699 nt		4.12	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	PSY3	YLR376C	729 nt		4.12	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	YMR178W	YMR178W	825 nt		4.12	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	GLO4	YOR040W	858 nt		4.12	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	SSO1	YPL232W	873 nt		4.12	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	MRPS9	YBR146W	837 nt		4.12	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	RAD26	YJR035W	3258 nt		4.12	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	SWP82	YFL049W	1872 nt		4.11	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	LAS1	YKR063C	1509 nt		4.11	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	RPC53	YDL150W	1269 nt		4.11	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	YGL258W-A	YGL258W-A	234 nt		4.11	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	tQ(UUG)C	tQ(UUG)C	72 nt		4.11	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	tQ(UUG)D1	tQ(UUG)D1	72 nt		4.11	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	tQ(UUG)D2	tQ(UUG)D2	72 nt		4.11	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	tQ(UUG)D3	tQ(UUG)D3	72 nt		4.11	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	tQ(UUG)E1	tQ(UUG)E1	72 nt		4.11	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	tQ(UUG)H	tQ(UUG)H	72 nt		4.11	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	tQ(UUG)L	tQ(UUG)L	72 nt		4.11	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	NSE1	YLR007W	1011 nt		4.11	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	YBR056W-A	YBR056W-A	201 nt		4.11	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	HSP26	YBR072W	645 nt		4.11	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	MDM38	YOL027C	1722 nt		4.11	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	RCM1	YNL022C	1473 nt		4.11	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	GPB1	YOR371C	2694 nt		4.1	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	YCR101C	YCR101C	549 nt		4.1	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	YHB1	YGR234W	1200 nt		4.1	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	GON7	YJL184W	372 nt		4.1	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	NKP2	YLR315W	462 nt		4.1	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	YLR407W	YLR407W	687 nt		4.1	□□□□□ -1.75

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