Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
THOP1P52888 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
THOP1P52888 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
THOP1P52888 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
THOP1P52888 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
THOP1P52888 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
THOP1P52888 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
THOP1P52888 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
THOP1P52888 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
THOP1P52888 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
THOP1P52888 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
THOP1P52888 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
THOP1P52888 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
THOP1P52888 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
THOP1P52888 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
THOP1P52888 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
THOP1P52888 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
THOP1P52888 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
THOP1P52888 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
THOP1P52888 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
THOP1P52888 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
THOP1P52888 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
THOP1P52888 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
THOP1P52888 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
THOP1P52888 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
THOP1P52888 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
THOP1P52888 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
THOP1P52888 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
THOP1P52888 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
THOP1P52888 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
THOP1P52888 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
THOP1P52888 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
THOP1P52888 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
THOP1P52888 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
THOP1P52888 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
THOP1P52888 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
THOP1P52888 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
THOP1P52888 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THOP1P52888 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
THOP1P52888 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
THOP1P52888 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
THOP1P52888 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THOP1P52888 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THOP1P52888 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THOP1P52888 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
THOP1P52888 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
THOP1P52888 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
THOP1P52888 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THOP1P52888 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
THOP1P52888 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THOP1P52888 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
THOP1P52888 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
THOP1P52888 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
THOP1P52888 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
THOP1P52888 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
THOP1P52888 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
THOP1P52888 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
THOP1P52888 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
THOP1P52888 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
THOP1P52888 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
THOP1P52888 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
THOP1P52888 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
THOP1P52888 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
THOP1P52888 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
THOP1P52888 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
THOP1P52888 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
THOP1P52888 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
THOP1P52888 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
THOP1P52888 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
THOP1P52888 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
THOP1P52888 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
THOP1P52888 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
THOP1P52888 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
THOP1P52888 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
THOP1P52888 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
THOP1P52888 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
THOP1P52888 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
THOP1P52888 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
THOP1P52888 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
THOP1P52888 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
THOP1P52888 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
THOP1P52888 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
THOP1P52888 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
THOP1P52888 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
THOP1P52888 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
THOP1P52888 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
THOP1P52888 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
THOP1P52888 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
THOP1P52888 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THOP1P52888 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
THOP1P52888 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
THOP1P52888 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THOP1P52888 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
THOP1P52888 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
THOP1P52888 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
THOP1P52888 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THOP1P52888 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THOP1P52888 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
THOP1P52888 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
THOP1P52888 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms