Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DAP3P51398 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DAP3P51398 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DAP3P51398 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DAP3P51398 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DAP3P51398 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DAP3P51398 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DAP3P51398 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DAP3P51398 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DAP3P51398 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DAP3P51398 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DAP3P51398 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DAP3P51398 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DAP3P51398 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DAP3P51398 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DAP3P51398 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DAP3P51398 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DAP3P51398 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DAP3P51398 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DAP3P51398 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DAP3P51398 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DAP3P51398 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
DAP3P51398 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DAP3P51398 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DAP3P51398 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DAP3P51398 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DAP3P51398 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DAP3P51398 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DAP3P51398 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DAP3P51398 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DAP3P51398 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DAP3P51398 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DAP3P51398 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
DAP3P51398 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DAP3P51398 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DAP3P51398 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DAP3P51398 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
DAP3P51398 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
DAP3P51398 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
DAP3P51398 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
DAP3P51398 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
DAP3P51398 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DAP3P51398 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DAP3P51398 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DAP3P51398 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DAP3P51398 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DAP3P51398 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
DAP3P51398 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DAP3P51398 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DAP3P51398 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DAP3P51398 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
DAP3P51398 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DAP3P51398 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
DAP3P51398 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DAP3P51398 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DAP3P51398 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DAP3P51398 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DAP3P51398 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DAP3P51398 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DAP3P51398 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DAP3P51398 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
DAP3P51398 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DAP3P51398 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DAP3P51398 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DAP3P51398 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DAP3P51398 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DAP3P51398 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DAP3P51398 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DAP3P51398 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DAP3P51398 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DAP3P51398 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DAP3P51398 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DAP3P51398 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DAP3P51398 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DAP3P51398 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DAP3P51398 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DAP3P51398 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DAP3P51398 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
DAP3P51398 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DAP3P51398 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DAP3P51398 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
DAP3P51398 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DAP3P51398 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DAP3P51398 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DAP3P51398 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DAP3P51398 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DAP3P51398 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DAP3P51398 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DAP3P51398 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DAP3P51398 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DAP3P51398 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DAP3P51398 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DAP3P51398 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DAP3P51398 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DAP3P51398 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DAP3P51398 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DAP3P51398 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DAP3P51398 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DAP3P51398 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DAP3P51398 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms