Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTPAP49638 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTPAP49638 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TTPAP49638 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTPAP49638 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTPAP49638 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTPAP49638 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TTPAP49638 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TTPAP49638 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTPAP49638 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TTPAP49638 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTPAP49638 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTPAP49638 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTPAP49638 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTPAP49638 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTPAP49638 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTPAP49638 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTPAP49638 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTPAP49638 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTPAP49638 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTPAP49638 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTPAP49638 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTPAP49638 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTPAP49638 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTPAP49638 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTPAP49638 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTPAP49638 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTPAP49638 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTPAP49638 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTPAP49638 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTPAP49638 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TTPAP49638 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTPAP49638 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TTPAP49638 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTPAP49638 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTPAP49638 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTPAP49638 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTPAP49638 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTPAP49638 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTPAP49638 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTPAP49638 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTPAP49638 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTPAP49638 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTPAP49638 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TTPAP49638 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTPAP49638 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTPAP49638 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTPAP49638 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTPAP49638 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTPAP49638 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTPAP49638 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTPAP49638 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTPAP49638 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTPAP49638 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTPAP49638 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTPAP49638 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTPAP49638 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTPAP49638 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTPAP49638 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTPAP49638 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTPAP49638 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTPAP49638 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTPAP49638 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTPAP49638 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTPAP49638 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTPAP49638 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTPAP49638 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTPAP49638 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TTPAP49638 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTPAP49638 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTPAP49638 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TTPAP49638 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTPAP49638 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTPAP49638 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTPAP49638 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTPAP49638 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTPAP49638 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTPAP49638 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTPAP49638 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTPAP49638 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTPAP49638 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTPAP49638 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTPAP49638 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTPAP49638 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTPAP49638 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTPAP49638 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTPAP49638 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTPAP49638 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTPAP49638 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTPAP49638 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTPAP49638 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TTPAP49638 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TTPAP49638 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTPAP49638 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTPAP49638 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTPAP49638 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTPAP49638 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTPAP49638 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTPAP49638 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTPAP49638 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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