Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CDK8P49336 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDK8P49336 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDK8P49336 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDK8P49336 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDK8P49336 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDK8P49336 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDK8P49336 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDK8P49336 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDK8P49336 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDK8P49336 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDK8P49336 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDK8P49336 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK8P49336 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK8P49336 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK8P49336 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK8P49336 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK8P49336 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK8P49336 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK8P49336 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK8P49336 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK8P49336 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK8P49336 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK8P49336 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK8P49336 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK8P49336 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK8P49336 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK8P49336 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK8P49336 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK8P49336 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK8P49336 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK8P49336 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK8P49336 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK8P49336 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK8P49336 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK8P49336 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK8P49336 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK8P49336 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK8P49336 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK8P49336 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK8P49336 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK8P49336 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK8P49336 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK8P49336 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK8P49336 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK8P49336 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK8P49336 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK8P49336 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK8P49336 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK8P49336 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK8P49336 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK8P49336 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK8P49336 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK8P49336 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK8P49336 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK8P49336 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK8P49336 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK8P49336 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK8P49336 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDK8P49336 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDK8P49336 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDK8P49336 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDK8P49336 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDK8P49336 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDK8P49336 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDK8P49336 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDK8P49336 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CDK8P49336 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDK8P49336 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDK8P49336 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CDK8P49336 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CDK8P49336 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CDK8P49336 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CDK8P49336 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CDK8P49336 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CDK8P49336 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDK8P49336 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CDK8P49336 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CDK8P49336 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CDK8P49336 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK8P49336 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK8P49336 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK8P49336 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK8P49336 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK8P49336 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK8P49336 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK8P49336 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK8P49336 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK8P49336 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK8P49336 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK8P49336 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK8P49336 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK8P49336 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK8P49336 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK8P49336 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK8P49336 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK8P49336 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK8P49336 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK8P49336 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK8P49336 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms