Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC11A1P49279 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC11A1P49279 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC11A1P49279 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC11A1P49279 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC11A1P49279 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC11A1P49279 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC11A1P49279 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC11A1P49279 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC11A1P49279 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC11A1P49279 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC11A1P49279 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC11A1P49279 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC11A1P49279 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC11A1P49279 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC11A1P49279 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC11A1P49279 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC11A1P49279 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC11A1P49279 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC11A1P49279 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC11A1P49279 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC11A1P49279 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC11A1P49279 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC11A1P49279 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC11A1P49279 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC11A1P49279 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC11A1P49279 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC11A1P49279 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC11A1P49279 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC11A1P49279 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC11A1P49279 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC11A1P49279 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC11A1P49279 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC11A1P49279 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC11A1P49279 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC11A1P49279 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC11A1P49279 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC11A1P49279 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC11A1P49279 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC11A1P49279 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC11A1P49279 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC11A1P49279 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC11A1P49279 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC11A1P49279 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC11A1P49279 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC11A1P49279 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC11A1P49279 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC11A1P49279 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC11A1P49279 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC11A1P49279 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC11A1P49279 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC11A1P49279 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC11A1P49279 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC11A1P49279 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC11A1P49279 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC11A1P49279 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC11A1P49279 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC11A1P49279 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC11A1P49279 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC11A1P49279 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC11A1P49279 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC11A1P49279 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC11A1P49279 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC11A1P49279 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC11A1P49279 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC11A1P49279 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC11A1P49279 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC11A1P49279 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC11A1P49279 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC11A1P49279 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC11A1P49279 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC11A1P49279 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC11A1P49279 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC11A1P49279 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC11A1P49279 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC11A1P49279 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC11A1P49279 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC11A1P49279 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC11A1P49279 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC11A1P49279 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC11A1P49279 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC11A1P49279 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC11A1P49279 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC11A1P49279 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC11A1P49279 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC11A1P49279 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC11A1P49279 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC11A1P49279 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC11A1P49279 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC11A1P49279 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC11A1P49279 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC11A1P49279 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC11A1P49279 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC11A1P49279 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC11A1P49279 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC11A1P49279 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC11A1P49279 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC11A1P49279 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC11A1P49279 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC11A1P49279 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms