Protein–RNA interactions for Protein: P48728

AMT, Aminomethyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMTP48728 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
AMTP48728 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMTP48728 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMTP48728 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMTP48728 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMTP48728 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMTP48728 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMTP48728 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMTP48728 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMTP48728 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMTP48728 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AMTP48728 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AMTP48728 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AMTP48728 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AMTP48728 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AMTP48728 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AMTP48728 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AMTP48728 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AMTP48728 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AMTP48728 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AMTP48728 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AMTP48728 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AMTP48728 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AMTP48728 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AMTP48728 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMTP48728 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMTP48728 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMTP48728 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMTP48728 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMTP48728 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMTP48728 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMTP48728 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMTP48728 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMTP48728 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMTP48728 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMTP48728 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMTP48728 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMTP48728 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMTP48728 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMTP48728 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMTP48728 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMTP48728 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMTP48728 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMTP48728 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMTP48728 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMTP48728 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMTP48728 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMTP48728 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMTP48728 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMTP48728 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMTP48728 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMTP48728 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMTP48728 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMTP48728 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMTP48728 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMTP48728 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AMTP48728 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AMTP48728 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
AMTP48728 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AMTP48728 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AMTP48728 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AMTP48728 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AMTP48728 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AMTP48728 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AMTP48728 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AMTP48728 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AMTP48728 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
AMTP48728 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AMTP48728 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AMTP48728 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AMTP48728 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AMTP48728 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AMTP48728 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AMTP48728 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AMTP48728 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AMTP48728 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AMTP48728 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
AMTP48728 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AMTP48728 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AMTP48728 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AMTP48728 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AMTP48728 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AMTP48728 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AMTP48728 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AMTP48728 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AMTP48728 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AMTP48728 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AMTP48728 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AMTP48728 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AMTP48728 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AMTP48728 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AMTP48728 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AMTP48728 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AMTP48728 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AMTP48728 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AMTP48728 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AMTP48728 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AMTP48728 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AMTP48728 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AMTP48728 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms