Protein–RNA interactions for Protein: P48552

NRIP1, Nuclear receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP1P48552 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NRIP1P48552 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NRIP1P48552 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NRIP1P48552 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NRIP1P48552 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NRIP1P48552 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NRIP1P48552 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NRIP1P48552 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NRIP1P48552 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NRIP1P48552 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NRIP1P48552 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NRIP1P48552 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NRIP1P48552 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NRIP1P48552 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NRIP1P48552 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NRIP1P48552 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NRIP1P48552 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NRIP1P48552 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NRIP1P48552 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NRIP1P48552 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NRIP1P48552 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NRIP1P48552 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NRIP1P48552 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NRIP1P48552 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NRIP1P48552 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NRIP1P48552 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NRIP1P48552 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NRIP1P48552 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NRIP1P48552 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NRIP1P48552 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NRIP1P48552 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NRIP1P48552 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NRIP1P48552 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NRIP1P48552 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NRIP1P48552 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NRIP1P48552 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NRIP1P48552 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NRIP1P48552 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NRIP1P48552 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NRIP1P48552 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NRIP1P48552 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NRIP1P48552 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NRIP1P48552 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NRIP1P48552 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NRIP1P48552 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NRIP1P48552 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NRIP1P48552 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NRIP1P48552 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NRIP1P48552 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NRIP1P48552 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NRIP1P48552 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NRIP1P48552 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NRIP1P48552 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NRIP1P48552 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NRIP1P48552 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NRIP1P48552 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NRIP1P48552 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NRIP1P48552 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NRIP1P48552 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NRIP1P48552 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NRIP1P48552 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NRIP1P48552 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NRIP1P48552 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NRIP1P48552 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NRIP1P48552 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NRIP1P48552 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NRIP1P48552 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NRIP1P48552 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NRIP1P48552 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NRIP1P48552 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NRIP1P48552 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NRIP1P48552 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NRIP1P48552 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NRIP1P48552 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NRIP1P48552 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NRIP1P48552 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NRIP1P48552 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NRIP1P48552 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NRIP1P48552 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NRIP1P48552 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NRIP1P48552 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NRIP1P48552 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NRIP1P48552 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NRIP1P48552 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NRIP1P48552 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NRIP1P48552 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NRIP1P48552 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NRIP1P48552 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NRIP1P48552 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NRIP1P48552 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NRIP1P48552 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NRIP1P48552 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NRIP1P48552 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NRIP1P48552 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NRIP1P48552 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NRIP1P48552 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NRIP1P48552 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NRIP1P48552 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NRIP1P48552 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NRIP1P48552 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms